| 请问,问题你解决了吗?我的问题和你一样可以a 交流一下吗? |
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我不用charmm-gui。.dx是一种格点数据文件格式,可以载入Multiwfn(http://sobereva.com/multiwfn。不过我只测试过和VMD的volmap插件产生的.dx的兼容性),然后用主功能13的选项0转换成常用得多得多的cub格式,cub格式在下文有详细说明 Gaussian型cube文件简介及读、写方法和简单应用 http://sobereva.com/125 “pore区的静电势”这种描述不准确。pore区域是一大块区域,里面每个位置的静电势都不一样,不知道你想获得什么形式的数据。 |
sobereva 发表于 2021-8-25 10:39 不好意思啊卢老师,我用的是APBS的pymol版,也用过APBS网页版,还用过charmm-gui网页版,计算静电势的时候最终都会生成一个.dx文件,我的蛋白是一个离子通道里面有pore,就是想问这些软件是否能自动识别蛋白跨膜表面和蛋白的通道区域,因为这些区域设置的dielectric数值不同。感谢您的回复 |
| 提问时候把前提说清楚,诸如莫名其妙来一句“做出来的dx文件”,主语都没有,用的什么程序别人都不知道,怎么回复。“...,软件会自动探测到空腔,填充溶剂?”你还让别人猜你用什么软件? |
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