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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › gromacs安装求助

gromacs安装求助

查看数: 6847 | 评论数: 6 | 收藏 Add to favorites 0

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发布时间: 2021-8-24 14:09

正文摘要:

按照老师的教程装了gromacs 2018.8, cmake 版本是3.21.1。装完运行gmx -version 如下所示。显示没有CPU信息等，请问各位老师这样能正常运行进行计算吗

回复 Reply

syd 发表于 Post on 2022-12-17 14:49:11

@jimulation 老师请问，我也遇到上述问题。按照老师教的方法在第一次安装后，SIMD instructions: NONE。随后再次编译时，cmake3那一步，在cmake3 .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/sob/gmx2018.8后面加了-DGMX_SIMD=AVX2_256，在看gmx -version时，出现下图。请问是什么原因呢？谢谢。

条件是VMware虚拟机。 CPU：Intel(R) Core(TM) i5-10210U CPU @ 1.60GHz 2.11 GHz

1671258798360(1).png (42.82 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

1671258798360(1).png

jimulation 发表于 Post on 2021-8-25 17:48:48

maipi 发表于 2021-8-25 13:44
请问具体是在哪一步加上这个啊？

http://sobereva.com/457
cmake3那一步

maipi 发表于 Post on 2021-8-25 13:44:34

jimulation 发表于 2021-8-24 15:15
可以试试能不能跑，能的话估计也会很慢
SIMD instructions: NONE
安装的时候加上-DGMX_SIMD=AVX2_256

请问具体是在哪一步加上这个啊？

maipi 发表于 Post on 2021-8-25 13:43:54

sobereva 发表于 2021-8-25 10:41
说清楚编译条件，什么CPU，实体机还是虚拟机

Sent OS7.6虚拟机。 CPU是Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2699 v3 @ 2.30GHz 2.30 。

sobereva 发表于 Post on 2021-8-25 10:41:19

说清楚编译条件，什么CPU，实体机还是虚拟机

jimulation 发表于 Post on 2021-8-24 15:15:58

可以试试能不能跑，能的话估计也会很慢
SIMD instructions: NONE
安装的时候加上-DGMX_SIMD=AVX2_256

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