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求助:福井函数等值面图怎么分析

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发布时间: 2021-9-3 21:34

正文摘要:

请问一下,是否有大神可以指导一下,下图该怎么分析,不同的颜色有什么含义,等值面的大小有什么含义 比如:f+图中绿色区域越大是否代表越容易发生请核反应?

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weiyiran 发表于 Post on 2021-11-8 07:23:18
非常感谢卢老师解答!这下就明白了!
sobereva 发表于 Post on 2021-11-6 17:55:50
weiyiran 发表于 2021-11-6 17:54
卢老师好!我在另一个帖子里http://bbs.keinsci.com/thread-26150-1-1.html提问了关于非中性分子(即离子 ...

如果是带一个正电荷的阳离子,当然是+1

“按照福井函数的含义,似乎N必须是中性分子”从来就没有这一条说法,这是你的极度误解。N始终代表的是体系原始状态的电子数
weiyiran 发表于 Post on 2021-11-6 17:54:24
sobereva 发表于 2021-9-4 02:28
把里面相关资料都仔细看了
亲电取代反应中活性位点预测方法的比较(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstra ...

卢老师好!我在另一个帖子里http://bbs.keinsci.com/thread-26150-1-1.html提问了关于非中性分子(即离子)福井函数计算的问题,有前辈帮解答了下,但还是不太理解。如果只计算阳离子部分当做N,那么他的电荷我是应该定为0还是+1呢?按照福井函数的含义,似乎N必须是中性分子,如果只计算阳离子部分,写成电荷为0,不符合实际情况啊。但是如果要写全部分子(阴离子是一个氯离子),优化又比较困难。想麻烦卢老师解答一下。
July 发表于 Post on 2021-9-17 10:15:15
sobereva 发表于 2021-9-15 01:29
f0是适合反应过程中两个物质间没有太显著电荷转移的情况的,自由基反应只不过往往是这种情况,不要把f0和 ...

好的,谢谢社长。
sobereva 发表于 Post on 2021-9-15 01:29:26
July 发表于 2021-9-14 10:18
嗯呢,明白了,谢谢社长。还有一个问题是单线态氧的话是比较f0的值来判断吗?因为f0值一般用来判断自由基 ...

f0是适合反应过程中两个物质间没有太显著电荷转移的情况的,自由基反应只不过往往是这种情况,不要把f0和预测自由基反应划等号
所以必须得知道具体是什么反应,不是光由其中一个反应物一方决定的
July 发表于 Post on 2021-9-14 10:18:45
sobereva 发表于 2021-9-11 02:38
通常你得先知道或大致估计有可能得到什么产物,对有可能参与反应的位点再根据福井函数之类的去判断哪个位 ...

嗯呢,明白了,谢谢社长。还有一个问题是单线态氧的话是比较f0的值来判断吗?因为f0值一般用来判断自由基的攻击位点,所以不清楚单线态氧是否也适用。
sobereva 发表于 Post on 2021-9-11 02:38:50
July 发表于 2021-9-10 19:20
被攻击的是环丙沙星分子,产物可能是脱掉一些基团或者破坏苯环

通常你得先知道或大致估计有可能得到什么产物,对有可能参与反应的位点再根据福井函数之类的去判断哪个位点可能优先反应。光是简单地看哪里数值最大并不靠谱,往往数值最大的原子根本不可能反应。
July 发表于 Post on 2021-9-10 19:20:48
sobereva 发表于 2021-9-10 02:22
得说清楚被攻击的体系是什么、可能得到什么产物

被攻击的是环丙沙星分子,产物可能是脱掉一些基团或者破坏苯环
sobereva 发表于 Post on 2021-9-10 02:22:45
July 发表于 2021-9-9 16:43
社长,请问福井函数方法是否适用于预测单线态氧的攻击位点,或者是否有其他的方法适用于预测单线态氧的攻 ...

得说清楚被攻击的体系是什么、可能得到什么产物
July 发表于 Post on 2021-9-9 16:43:25
sobereva 发表于 2021-9-4 02:28
把里面相关资料都仔细看了
亲电取代反应中活性位点预测方法的比较(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstra ...

社长,请问福井函数方法是否适用于预测单线态氧的攻击位点,或者是否有其他的方法适用于预测单线态氧的攻击位点
July 发表于 Post on 2021-9-8 14:59:34
snljty 发表于 2021-9-4 15:45
如果Hirshfeld电荷是Gaussian算的,GaussView就可以看,或者找个Gaussian的输出文件,把电荷替换掉之前的 ...

嗯呢,学会了,谢谢
snljty 发表于 Post on 2021-9-4 15:45:12
July 发表于 2021-9-4 15:17
谢谢社长,我需要消化一下。再请教您一个问题,Hirshfeld电荷的计算结果可以可视化吗?可以的话具体是怎 ...

如果Hirshfeld电荷是Gaussian算的,GaussView就可以看,或者找个Gaussian的输出文件,把电荷替换掉之前的Mulliken电荷部分然后看。更好的是用VMD看pqr文件,pqr文件可以用Multiwfn生成。看卢老师博文《使用Multiwfn+VMD以原子着色方式表现原子电荷、自旋布居、电荷转移、简缩福井函数》http://bbs.keinsci.com/thread-10163-1-1.html
July 发表于 Post on 2021-9-4 15:17:57
sobereva 发表于 2021-9-4 02:28
把里面相关资料都仔细看了
亲电取代反应中活性位点预测方法的比较(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstra ...

谢谢社长,我需要消化一下。再请教您一个问题,Hirshfeld电荷的计算结果可以可视化吗?可以的话具体是怎么操作的?
July 发表于 Post on 2021-9-4 14:14:45
sobereva 发表于 2021-9-3 21:59
这么大红字还看不见么???为什么发到公社大厅板块???

好的,谢谢社长,下次会注意

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