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甭用gview就完了,用Multiwfn看轨道效果好得多速度快得多还完全免费 使用Multiwfn观看分子轨道 http://sobereva.com/269(http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html) 使用Multiwfn+VMD快速绘制高质量分子轨道等值面图(含视频演示) http://sobereva.com/447(http://bbs.keinsci.com/thread-11122-1-1.html) 用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法(含演示视频) http://sobereva.com/449(http://bbs.keinsci.com/thread-11550-1-1.html) 好好把GaussView拼对,这里强调了 计算化学中的一些常见不良写法和用词 http://sobereva.com/298(http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html) 如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“使用gaussian绘制homo轨道”改了,以后务必注意,下次将删帖+扣分处理。 |
| 你让卢老师的 Multiwfn 情何以堪... |
九只獬豸羊 发表于 2021-9-11 10:41 肯定是不对的(除非你算的是光/金属参与的反应,默认DNA上一个电子被打出去/转移到金属上),没多少原子,自己检查几遍就看出来了。 |
zjxitcc 发表于 2021-9-11 10:12 谢谢解答,但是在输入文件中,我整体负电荷数就是磷酸根的数目,应该没得问题吧。 |
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(1)你这看上是在计算碱基片段,一般碱基片段大家都是研究单重态,而整体的电荷取决于用户补多少个氢。你大概率是构建错了几何结构,有些位置多氢、少氢没注意看。在未补氢前,所有的负电荷应该均集中在磷酸根负离子上,补一个氢的话整体电荷就+1.对于生物体系,要结合生物化学知识判断结构是否合理,结果错了,后续算上天去也没用。 (2)“分子比较大的还会cube生成失败”->内存不足,或者说指定的内存不足。可以换个软件看轨道,就没这些问题了;坚持用GaussView也行,需要在linux下先产生cube文件,然后在本地用GaussView打开cube文件观看。在(1)没解决前,请不要关注(2)。 |
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