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本帖最后由 WEILANDREW 于 2021-9-25 15:15 编辑 1. 将xyz文件导入ovito或vesta,以笛卡尔坐标格式导出POSCAR文件,然后更改表头ABC晶胞参数 2. 将xyz文件导入到VMD中,由于xyz文件中没有晶胞边长信息,在VMD命令行窗口中输入 pbc set {a b c α β γ},和 pbc box -style lines即可,边长粗细和颜色自行调整 |
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可以用Multiwfn(http://sobereva.com/multiwfn)载入xyz文件,用主功能100的子功能2转成pdb格式,自己在开头添加CRYST1字段把晶胞信息手写进去,再载入VESTA CRYST1字段示例
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| 可以用VESTA将文件转化成Cif,cmf格式然后用MS打开,点击Build Symmetry Supercell然后设置ABC晶胞参数就好 |
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我了解的方案有三: 1、将xyz用ase读为ase.Atoms的类,然后给Atoms设置cell,然后在写入到cif。 2、将xyz用vesta读取,存成vesta,然后修改vesta文件来增加PBC。 3、ase转换为其他的如MS的car文件,然后手工修改car文件添加PBC,最后再转cif。 但不限于这三种做法。 |
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