求助，使用gromacs的x2top创建力场时出现问题

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zll

发布时间: 2021-9-22 15:06

出现的问题请问各位老师，应该怎么修改呢

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zll 发表于 Post on 2021-9-23 10:33:57

sobereva 发表于 2021-9-23 06:32
信息不充分，体系结构图或结构文件都没有，没法判断n2t是否合理
直接导致这种提示的原因就是n2t文件定义得 ...

好的，谢谢。我再试试

sobereva 发表于 Post on 2021-9-23 06:32:02

信息不充分，体系结构图或结构文件都没有，没法判断n2t是否合理
直接导致这种提示的原因就是n2t文件定义得不合理，只能反复检查。

另外，不排除个别版本有bug的可能。如果绝对确信n2t与结构文件对应没问题，别用这么老版本，用新版本再试

zll 发表于 Post on 2021-9-22 16:09:34

Lacrimosa 发表于 2021-9-22 16:03
看报错信息应该是H-O的距离不太合适，你可以先量一下再相应修改一下n2t文件中H-O的距离

已经修改好多次O-H的距离了，还是不对

Lacrimosa 发表于 Post on 2021-9-22 16:03:37

看报错信息应该是H-O的距离不太合适，你可以先量一下再相应修改一下n2t文件中H-O的距离

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