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求助,使用gromacs的x2top创建力场时出现问题

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zll
发布时间: 2021-9-22 15:06

正文摘要:

出现的问题 请问各位老师,应该怎么修改呢

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zll 发表于 Post on 2021-9-23 10:33:57
sobereva 发表于 2021-9-23 06:32
信息不充分,体系结构图或结构文件都没有,没法判断n2t是否合理
直接导致这种提示的原因就是n2t文件定义得 ...

好的,谢谢。我再试试
sobereva 发表于 Post on 2021-9-23 06:32:02
信息不充分,体系结构图或结构文件都没有,没法判断n2t是否合理
直接导致这种提示的原因就是n2t文件定义得不合理,只能反复检查。

另外,不排除个别版本有bug的可能。如果绝对确信n2t与结构文件对应没问题,别用这么老版本,用新版本再试
zll 发表于 Post on 2021-9-22 16:09:34
Lacrimosa 发表于 2021-9-22 16:03
看报错信息应该是H-O的距离不太合适,你可以先量一下再相应修改一下n2t文件中H-O的距离

已经修改好多次O-H的距离了,还是不对
Lacrimosa 发表于 Post on 2021-9-22 16:03:37
看报错信息应该是H-O的距离不太合适,你可以先量一下再相应修改一下n2t文件中H-O的距离

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