如何解决rdkit可视化分子模块MolToImage()，输出图片结构重叠？

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发布时间: 2021-9-28 12:11

本帖最后由 ShangChien 于 2021-11-5 13:24 编辑最近学习RDkit，想实现高通量可视化分子smiles，但是MolToImage()函数生成的图片总会有少量分子的结构是重叠的（如下图红色圈内），很影响观看（心里膈应）。不 ...

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flyingchow 发表于 Post on 2021-10-3 01:26:08

用最新版本的rdkit
然后用：
from rdkit.Chem import rdDepictor
rdDepictor.SetPreferCoordGen(True)

链接： https://github.com/rdkit/rdkit/issues/2960

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ShangChien	+ 5	谢谢

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