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请教各位老师，如何进行组装体和蛋白质的分子对接呢？

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CMMCMM

发布时间: 2021-9-28 15:37

正文摘要:

组装体有24条相同的多肽链组成，受体蛋白是PKM2(PKM2被认为是肿瘤疾病治疗的理想靶点).

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CMMCMM 发表于 Post on 2021-9-29 09:30:14

sobereva 发表于 2021-9-28 18:28
什么叫组装体？
你贴的二维结构图是什么东西？
24条在哪里体现的？

1、我贴的二维结构图是PKM2（受体）的同源二聚体；
2、然后贴的另一条多肽链是组装体的起始链，我用这一条多肽链堆积成12条平行排列的组装体。这12条组装体MD模拟后是β-sheet结构。
3、我最后想用pkm2与模拟后的这个β-sheet结构进行分子对接。就是不知道该怎么进行，autodock不支持。所以请教一下老师

sobereva 发表于 Post on 2021-9-28 18:28:00

什么叫组装体？
你贴的二维结构图是什么东西？
24条在哪里体现的？

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