gromacs中的velacc没有类似于msd中的-trestart选项吗

查看数: 4891 | 评论数: 3 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2021-10-10 16:39

gromacs的velacc模块可以计算速度自相关(vacf)，而msd模块可以计算均方位移(msd)。而msd和velacc均涉及到t时刻的性质与0时刻的性质的运算，感觉二者的算法应该比较类似。但是msd模块中有-trestart选项可以指定时间起 ...

回复 Reply

Daniel_Arndt 发表于 Post on 2021-11-14 10:28:57

gromacs的dos相应代码可能有一些问题，这篇文献 https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.1c00156 提及了。你可以看Supporting Information里面的代码。至于velacc有没有类似的问题，我就不清楚了，我也不是做这些的。

sobereva 发表于 Post on 2021-10-11 04:22:16

应当是没有设这个的选项。直接读源代码看看

参与人数 Participants 1	eV +1	收起理由 Reason
tomato	+ 1	谢谢

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register