本帖最后由 哈库呐玛塔塔 于 2022-10-24 16:50 编辑 老师,我想请问,我先用Multiwfn计算了分子的静电势得到了两个cub文件,分别是density.cub和totesp.cub文件,然后将这两个cub文件复制到vmd文件下,但是打开vmd时,输入source ESP.vmd时,无法识别这两个cub文件,请问是怎么回事? |
屏幕截图 2022-10-24 164837.png (91.41 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)
lyj714 发表于 2021-10-13 18:22 谢谢大神!从您提供帖子里下载64位VMD并安装之后,可以成功打开这个二聚体的静电势图了! |
我个人认为是官网那个VMD对于windows只是32位的缘故。我用我编译的64位的vmd1.9.3没任何问题: http://bbs.keinsci.com/thread-23119-1-1.html ![]() |
谢谢sob老师,这个体系是一个二聚体,我试了多次之后还是无法正常显示静电势。我换了一个小一点的体系之后,发现是可以正常显示静电势的。所以应该还是我电脑配置的问题吧,我再想想其他办法,再次谢谢您! |
估计是vtx1.pdb太大再加上VMD有些bug所致。是否能正常载入有一定随机性,我用VMD 1.9.3 32bit,第一次输入pt也出现了崩溃问题,不过第二次启动VMD再输入pt就能正常载入了。建议你多试几次,应该能有一次成功。![]() |
sobereva 发表于 2021-10-12 03:42 Sob老师,相关文件已上传,请查阅,谢谢! |
把vtx1.pdb,mol1.pdb,surfanalysis.pdb压缩后上传 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2025-8-13 21:28 , Processed in 0.327022 second(s), 25 queries , Gzip On.