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求助:Multiwfn结合VMD绘制静电势,VMD报错退出问题

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发布时间: 2021-10-12 00:24

正文摘要:

本帖最后由 Trivers 于 2021-10-12 17:05 编辑 请教各位大神:        我学习了博文使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)(http://soberev ...

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哈库呐玛塔塔 发表于 Post on 2022-10-24 16:49:01
本帖最后由 哈库呐玛塔塔 于 2022-10-24 16:50 编辑

老师,我想请问,我先用Multiwfn计算了分子的静电势得到了两个cub文件,分别是density.cub和totesp.cub文件,然后将这两个cub文件复制到vmd文件下,但是打开vmd时,输入source ESP.vmd时,无法识别这两个cub文件,请问是怎么回事?

屏幕截图 2022-10-24 164837.png (91.41 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

屏幕截图 2022-10-24 164837.png
Trivers 发表于 Post on 2021-10-13 20:17:49
lyj714 发表于 2021-10-13 18:22
我个人认为是官网那个VMD对于windows只是32位的缘故。我用我编译的64位的vmd1.9.3没任何问题:
http://bbs ...

谢谢大神!从您提供帖子里下载64位VMD并安装之后,可以成功打开这个二聚体的静电势图了!
lyj714 发表于 Post on 2021-10-13 18:22:30
我个人认为是官网那个VMD对于windows只是32位的缘故。我用我编译的64位的vmd1.9.3没任何问题:
http://bbs.keinsci.com/thread-23119-1-1.html
Trivers 发表于 Post on 2021-10-13 17:34:33
谢谢sob老师,这个体系是一个二聚体,我试了多次之后还是无法正常显示静电势。我换了一个小一点的体系之后,发现是可以正常显示静电势的。所以应该还是我电脑配置的问题吧,我再想想其他办法,再次谢谢您!
sobereva 发表于 Post on 2021-10-13 02:59:46
估计是vtx1.pdb太大再加上VMD有些bug所致。是否能正常载入有一定随机性,我用VMD 1.9.3 32bit,第一次输入pt也出现了崩溃问题,不过第二次启动VMD再输入pt就能正常载入了。建议你多试几次,应该能有一次成功。


Trivers 发表于 Post on 2021-10-12 17:06:22
sobereva 发表于 2021-10-12 03:42
把vtx1.pdb,mol1.pdb,surfanalysis.pdb压缩后上传

Sob老师,相关文件已上传,请查阅,谢谢!
sobereva 发表于 Post on 2021-10-12 03:42:11
把vtx1.pdb,mol1.pdb,surfanalysis.pdb压缩后上传

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