计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

gaussian16优化分子结构时加和不加opt=recalc=3得到的构型差别很大?

查看数: 6442 | 评论数: 5 | 收藏 Add to favorites 2
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2021-10-23 14:38

正文摘要:

我用Gaussian 16优化一个含有C,H,Se元素碗状分子的结构,先是用#p opt b3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity,得到了四个YES都收敛了,但是分子结构确是平面的。 然后我又用#p opt=recalc=3 b3lyp/6-311g(d,p) geom ...

回复 Reply

zhangzb 发表于 Post on 2021-10-23 15:55:46
fffff 发表于 2021-10-23 15:38
此回答只针对于“这是不是意味着如果只做opt得到的结果是不可靠的。”,这种体系没算过,不了解会不会有其 ...

受教,谢谢您!
zhangzb 发表于 Post on 2021-10-23 15:55:07
wzkchem5 发表于 2021-10-23 15:29
opt=recalc=n freq也不能严格保证没有虚频(除非n=1,但此时计算量太大)。本来结构优化就是有一定概率得 ...

受教,谢谢您!
fffff 发表于 Post on 2021-10-23 15:38:28
本帖最后由 fffff 于 2021-10-23 15:47 编辑

此回答只针对于“这是不是意味着如果只做opt得到的结果是不可靠的。”,这种体系没算过,不了解会不会有其他坑。
1.一般opt完需要在同一级别做freq检验有无虚频,从而判断是否处于极小点。opt顺利收敛≠结果有意义,比如H2O2直接用gview搭成平面结构去优化,opt能正常收敛,优化出平面结构,但是freq会显示有一个虚频,那这个平面结构就不是势能面上的极小点,需要破坏对称性后重新优化。
2.opt只能优化到离初猜结构最近的极小点,无法实现自动优化到全局极小点。大多体系拿局部极小点去研究某些性质显然不合理,优化到局部极小点的情况即便opt收敛,freq没虚频,结果也不能直接拿来用,需要做构象搜索,计算构象分布等操作。

wzkchem5 发表于 Post on 2021-10-23 15:29:46
本帖最后由 wzkchem5 于 2021-10-23 08:33 编辑
zhangzb 发表于 2021-10-23 08:16
补充:
基于这两个结构的频率计算结果:
1. 平面结构三个收敛,Maximum Displacement没有收敛,而且存在 ...

opt=recalc=n freq也不能严格保证没有虚频(除非n=1,但此时计算量太大)。本来结构优化就是有一定概率得到有虚频的结构,不能说一个优化方法有时会得到有虚频的结构,这个方法就是错的。用一个不保证没有虚频的方法优化,然后如果有虚频再消虚频,从概率上讲可能比用一个保证没有虚频的方法优化更快。
所以freq是必须的,检查有没有虚频、如果有的话把虚频消掉也是必须的,但recalc不是必须的。
zhangzb 发表于 Post on 2021-10-23 15:16:03
本帖最后由 zhangzb 于 2021-10-23 15:24 编辑

补充:
基于这两个结构的频率计算结果:
1. 平面结构三个收敛,Maximum Displacement没有收敛,而且存在虚频;
2. 碗状结构四个都收敛,没有虚频。

另外,将上述分子中的Se原子换成S原子的另外一个分子,用#p opt freq b3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity和#p opt=recalc=3 freq b3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity分别计算的结果却是相同的。

我的问题是,以后优化分子结构的时候opt=recalc=n freq是不是成为必须的了,因为如果只用opt freq最后算出来虚频的话还是要再重新计算。
谢谢大家!

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 03:30 , Processed in 0.172707 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list