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IRC产物拿出来OPT,结构变形

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发布时间: 2016-1-21 10:26

正文摘要:

本帖最后由 小书童 于 2016-1-24 17:20 编辑 对算好的过渡态进行IRC路径分析,得到的了反应物和产物,与振动趋势相同。将产物(中间体)拿出来OPT,结构优化的结果结构扭曲了。 想请问老师这个是为什么呢?怎么 ...

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abcd401 发表于 Post on 2023-9-24 16:17:15
小书童 发表于 2016-1-30 10:02
老师结构频率分析完成了,有虚频,而且虚频正是变形的方向。那么,对于这个问题可能的原因是什么呢?我的 ...

你好,请问你这个问题解决了吗?我跟你遇到了同样的问题,IRC左端的产物结构和opt优化出来的不一样,你是怎么解决的?
小李子赛 发表于 Post on 2020-4-22 11:43:08
sobereva 发表于 2020-4-22 04:17
不意味什么,单纯是优化不充分而已,参看
Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法 ...

嗯嗯,谢谢老师。
sobereva 发表于 Post on 2020-4-22 04:17:45
小李子赛 发表于 2020-4-20 20:46
老师,如果IRC端点结构优化后有虚频,意味着什么呢?

不意味什么,单纯是优化不充分而已,参看
Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法
http://sobereva.com/278http://bbs.keinsci.com/thread-633-1-1.html
小李子赛 发表于 Post on 2020-4-20 20:46:17
sobereva 发表于 2016-1-21 12:22
优化后的结构有虚频没有?没虚频说明极小点就是那样

老师,如果IRC端点结构优化后有虚频,意味着什么呢?
小书童 发表于 Post on 2016-2-25 08:46:23

恩恩,好的,谢谢老师的指点!
sobereva 发表于 Post on 2016-2-24 23:19:57
小书童 发表于 2016-2-24 21:48
那老师咱们这个反应路径的搜索就到此为止了吧,不能够在往下找了对吧?

y
小书童 发表于 Post on 2016-2-24 21:48:04
sobereva 发表于 2016-2-24 16:00
你当前的反应就是个N-N键变成N-O键。如果你想脱出N2来,那还得尝试另外找对应的过渡态,但看起来难度很大。

那老师咱们这个反应路径的搜索就到此为止了吧,不能够在往下找了对吧?
sobereva 发表于 Post on 2016-2-24 16:00:43
你当前的反应就是个N-N键变成N-O键。如果你想脱出N2来,那还得尝试另外找对应的过渡态,但看起来难度很大。
sobereva 发表于 Post on 2016-2-23 14:37:30
小书童 发表于 2016-2-23 08:53
不是啊,那个平面结构是从IRC末端取出来的,您告诉我对其直接进行振动分析,结果发现这个点有一个虚频, ...

我记错了。
如果这样,你就直接拿这个点搜索过渡态再走IRC就好了,应该会连接两个对映异构体
小书童 发表于 Post on 2016-2-23 08:53:01
sobereva 发表于 2016-2-22 19:45
有可能,但是我记得你说过没虚频

不是啊,那个平面结构是从IRC末端取出来的,您告诉我对其直接进行振动分析,结果发现这个点有一个虚频,您才说可能是分叉了的。如果是我刚才说的那样的话,ts2就相当与直接找到了?
sobereva 发表于 Post on 2016-2-22 19:45:58
小书童 发表于 2016-2-22 19:36
好的,我试试。还有老师,过渡态会不会就是那个平面的机构呢?

有可能,但是我记得你说过没虚频
小书童 发表于 Post on 2016-2-22 19:36:15
sobereva 发表于 2016-2-22 12:11
拿对映异构体作为QST2的反应物和产物,尝试找到过渡态,然后产生IRC验证

好的,我试试。还有老师,过渡态会不会就是那个平面的机构呢?
liyuanhe211 发表于 Post on 2016-2-22 12:37:34
小书童 发表于 2016-1-30 10:02
老师结构频率分析完成了,有虚频,而且虚频正是变形的方向。那么,对于这个问题可能的原因是什么呢?我的 ...

这个结构本身就不应该是平面的。稍微破坏平面性之后优化。

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