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VEDA4中显示的频率与Gaussian计算得到频率完全不一样,但简正振动模式数量一样。

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发布时间: 2021-10-25 15:51

正文摘要:

各位老师好,我想问一下关于VEDA4的问题。我在Linux服务器上使用Gaussian计算得到.chk文件,并使用formchk转化为fchk文件,然后下载到本机Windows系统使用VEDA4进行分析。发现VEDA4中.vd文件显示的频率与使用Gaussia ...

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小庄师弟 发表于 Post on 2022-2-19 17:39:53
ZeeWong 发表于 2022-2-19 15:27
您好,这个问题我没遇到过,但我看veda的官网上有一个专门的版本,上面写着veda version for up tp 480 a ...

好的,我去官网找一下其他版本。我试了一下,把opt和freq分开计算解决了频率不同的问题,非常感谢。
ZeeWong 发表于 Post on 2022-2-19 15:27:41
小庄师弟 发表于 2022-2-18 22:01
好的,谢谢,我去试一下。还有 一个问题想请教一下,当分子体系比较大时(100个原子左右),使用.fmu文件 ...

您好,这个问题我没遇到过,但我看veda的官网上有一个专门的版本,上面写着veda version for up tp 480 atoms。或许那个版本能解决您的问题。
veda官网:smmg.pl/software/veda
小庄师弟 发表于 Post on 2022-2-18 22:03:06
小庄师弟 发表于 2022-2-18 22:01
好的,谢谢,我去试一下。还有 一个问题想请教一下,当分子体系比较大时(100个原子左右),使用.fmu文件 ...

具体报错请看
求助:VEDA4软件打开.fmu文件失败,显示文件中缺少返回值
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 8&fromuid=30674
(出处: 计算化学公社)
小庄师弟 发表于 Post on 2022-2-18 22:01:19
ZeeWong 发表于 2022-2-17 23:15
试试在计算关键词中只用freq,而不是使用opt freq。按我的经验,opt freq会出现如您所述的问题。把opt和fre ...

好的,谢谢,我去试一下。还有 一个问题想请教一下,当分子体系比较大时(100个原子左右),使用.fmu文件导入失败,您遇到过这个问题吗?
ZeeWong 发表于 Post on 2022-2-17 23:15:28
试试在计算关键词中只用freq,而不是使用opt freq。按我的经验,opt freq会出现如您所述的问题。把opt和freq分开成两个任务计算则不会。

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参与人数
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eV +9 收起 理由
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Xulx2022 + 4 不明觉厉
小庄师弟 + 5 正解

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小庄师弟 发表于 Post on 2021-12-20 15:51:46
dantevinsky 发表于 2021-12-20 14:39
啊这,我没用过VEDA,但是感觉不应该啊,为啥会跟计算环境有关,这就很不鲁棒了

这个问题很棘手,在服务器上的计算结果都会出现0.01,-0.01类似的频率。
dantevinsky 发表于 Post on 2021-12-20 14:39:58
小庄师弟 发表于 2021-12-20 09:36
是的,这个分子里面有三个苯环。我感觉与计算环境也有关,我用CH4,H2O试过,在本机Windows系统下计算后 ...

啊这,我没用过VEDA,但是感觉不应该啊,为啥会跟计算环境有关,这就很不鲁棒了
小庄师弟 发表于 Post on 2021-12-20 09:36:27
dantevinsky 发表于 2021-12-20 09:18
你的分子是不是多环/比较复杂,导致VEDA的PED分析没有找到很好的一组内坐标?

是的,这个分子里面有三个苯环。我感觉与计算环境也有关,我用CH4,H2O试过,在本机Windows系统下计算后,用VEDA4分析,两列频率一样,用服务器算完之后,两列频率就不一样。最近算的两个100多个原子的体系,fchk有200多兆,然后转换成fmu就直接导入不进去。
dantevinsky 发表于 Post on 2021-12-20 09:18:51
你的分子是不是多环/比较复杂,导致VEDA的PED分析没有找到很好的一组内坐标?

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