求助：请问如何用gromacs得到氢键自相关函数

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发布时间: 2021-10-28 18:26

请问如何用gromacs计算氢键自相关函数C(t)呢？我得到了hblife.xvg这个数据，不知道出现的两条曲线p(t)和tp(t)分别是什么含义。这个和C(t)有关系吗？

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邱美佳 发表于 Post on 2021-10-29 10:28:50

sobereva 发表于 2021-10-29 06:19
p(t)：从0时刻开始能一直持续到t的氢键的概率
t p(t)：p(t)与t的乘积

请问卢老师这个p（t）和C（t）含义是一样的吗？C（t）也是体现氢键能维持t时间的概率

sobereva 发表于 Post on 2021-10-29 06:19:37

p(t)：从0时刻开始能一直持续到t的氢键的概率
t p(t)：p(t)与t的乘积

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