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Gaussian优化出错退出

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发布时间: 2021-11-1 10:56

正文摘要:

       各位老师好:本人优化该分子出错,请各位老师看看是什么原因。万分感谢(新手小白) 输入文件请见附件 以下为部分输出文件: GradGradGradGradGradGradGradGradGradG ...

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曾yw 发表于 Post on 2021-11-2 09:23:27
wzkchem5 发表于 2021-11-1 15:59
另外,如果是gaussview直接画的结构,除非是很小的分子(十几个原子以内),否则建议先用PM6或者UFF优化 ...

非常感谢老师的指点
wzkchem5 发表于 Post on 2021-11-1 15:59:21
曾yw 发表于 2021-11-1 05:16
非常感谢老师的指点,我会认真看相关内容。

另外,如果是gaussview直接画的结构,除非是很小的分子(十几个原子以内),否则建议先用PM6或者UFF优化,再做DFT计算,不然白白浪费DFT计算时间不说,还会增加SCF不收敛的概率
曾yw 发表于 Post on 2021-11-1 12:16:24
非常感谢老师的指点,我会认真看相关内容。
tiandikuoyuan 发表于 Post on 2021-11-1 11:21:16
结构构建错了,O上少了个氢原子。这种结构有chemdraw数据的话,直接用chemdraw3D打开应该能生成比较好的初始结构。
zjxitcc 发表于 Post on 2021-11-1 11:11:49
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-11-1 11:15 编辑

先别管报错。存在大量问题:
(1)结构不合理。结构似乎是你自己构建的,有一对O-O键长过短,如果你是新手,面对这么复杂的结构,最好的办法是去前人文献里找相同、类似的结构,或去晶体库里找现成结构进行合理的截取。

(2)你这文件写着中性、二重态(即自由基),而看结构像常规有机结构,不太可能是自由基。是/否自由基 在计算量上相差很多,算出来性质也差别很大。不要盲目相信GaussView判断的电荷和自旋多重度。如果你不清楚自己在算什么,应立即请教实验室师兄。

(3)基组完全不合理,这文件算出来也没用。看《谈谈量子化学中基组的选择》http://sobereva.com/336
估计你也不知道要加色散校正,看这篇《谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”》http://sobereva.com/413

(4)这么大的文件才给1GB内存,这就像小刀割麦田,刀断了也是正常的。如果你是囿于Win版Gaussian只能用1.4GB内存,应该立即改用Linux g16,效率高计算快,节约时间,时间=生命。如果你觉得自己不会装linux系统,这也很简单,直接在Win10下安装WSL就可以同时使用两个系统了,然后在WSL里使用Linux g16。

(5)geom=conn和坐标底下的连接关系可以删去,量子化学计算不依赖于这些没用的东西,只会增加文件大小。

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