liustone 发表于 2021-11-5 11:18
谢谢sob老师，我使用# opt=modredundant b3lyp/6-311+g(d,p) scrf=(solvent=water) nosymm 指令进行了柔 ...

你可以用M06-2X也扫一下看看，如果也是如此，基本可以说明

wzkchem5 发表于 2021-11-2 17:03
无垒反应也可能是决速步。参见https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ar1000956和http://sobereva.com/506

您好，谢谢指导。sob老师的这篇帖子和这篇文献我大概看过了，尤其是文献讲的是催化剂下动力学评价的好像是，质子转移反应的无能垒反应是决速步的研究群里有人问过嘛？

liustone 发表于 2021-11-2 18:44
好的，谢谢sob老师指导，我来做个柔性扫描严谨地判断是否有过渡态，但是好像质子转移反应一般是无垒反应 ...

也可以有能垒

sobereva 发表于 2021-11-2 12:04
就这么点体系，直接用DFT结合中等基组做个柔性扫描判断有无过渡态就完了，又花不了多少时间。半经验即便判 ...

好的，谢谢sob老师指导，我来做个柔性扫描严谨地判断是否有过渡态，但是好像质子转移反应一般是无垒反应吧。

liustone 发表于 2021-11-2 04:52
各位老师好，我们基于过渡态理论计算羰基硫与胺反应过程，按照机理是如下图这两个方程，我们计算的第一步反 ...

无垒反应也可能是决速步。参见https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ar1000956和http://sobereva.com/506

就这么点体系，直接用DFT结合中等基组做个柔性扫描判断有无过渡态就完了，又花不了多少时间。半经验即便判断是否有过渡态也有不靠谱的风险。另外你写RFO完全多余，写verytight更是不仅多余还极其碍事，如果你都不知道监控优化过程，很可能始终也达不到严到这么变态的收敛限、导致你以为始终没找到过渡态（哪怕其实都已经找到了）

必须考虑溶剂模型

看不到图是啥样的，质子转移的能垒一般较低
https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jacs.7b05964
https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.accounts.0c00444

建议做个柔性扫描看看是不是无垒反应

这种酸碱中和不一定有过渡态吧，就算有过渡态能垒也会很低吧