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求助:用gromacs统计水分子的键角分布结果很奇怪

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发布时间: 2021-11-1 16:41

正文摘要:

我用gmx angle统计水分子的键角分布,可是出来的结果都是30多度,这个数值是怎么来的呢?水分子的键角不是应该是104度左右吗?

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sobereva 发表于 Post on 2021-11-1 17:06:30
肯定是你的统计方式不对
而且平时用的水模型都是刚性水模型,H-O-H键角是水模型定义的特定的值,严格不变,因此统计H-O-H键角没意义。
如果你说的是氢键键角,那是另外一码事。

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