coolrainbow 发表于 2026-4-2 09:06
（1）这个我可以加个选项控制输出细节。之前有人反应输出太少了，我才加的
(2)其实我不太推荐gfn-ff ...

谢谢张老师解答，原子数太多用gfn1/gfn2跑10000帧一周都跑不完，还是希望能用geom里的gfn-ff跑，按说不应该断键，麻烦您看看是不是有bug，谢谢。我用xtb软件里的gfn-ff跑动力学没有断键的现象，但是我觉得动力学采样的构象空间肯定不如蜂群算法来得大，找到全局最小构象的概率小。

lanthanum 发表于 2026-1-26 03:54
张老师好，反馈两个问题。（1）用geom组件搜索单一分子构象时，用gfn-ff搜索10000帧，产生的out文件高达21G ...

（1）这个我可以加个选项控制输出细节。之前有人反应输出太少了，我才加的
(2)其实我不太推荐gfn-ff，他的精度还是太低了。gfn1或者gfn2是这个领域最好的选择之一，哪怕速度慢点都可以接受

张老师好，反馈两个问题。（1）用geom组件搜索单一分子构象时，用gfn-ff搜索10000帧，产生的out文件高达21GB，每一步优化的细节都显示了，其实可以不显示细节，如同gfn2-xtb优化时那样只显式帧号和能量即可。（2）最大的问题是键连关系改变了，有的化学键断了重新组合了，这是gfn-ff的问题吗？用相同的xyz文件，用gfn2-xtb搜索构象，就不会改变键连关系，这是正确的，但是速度太慢了。

老师您好，我第一次用这个软件 为什么会显示这样的报错锕

请教两个问题，（1）想用ABCluster软件包里geom搜索过渡态的构象，需要约束三个自由度（两键长一键角，或三个键长），就是说在设置了柔性参数nH nH旋转二面角情况下，键长固定住不要优化，应如何设置？（2）手册里说，连接关系里1.0键级是可旋转键，2.0，3.0是不可旋转键，请问程序如何处理0.5，1.5键级，是否可旋转？谢谢。

怎么引用

网站加载好慢啊

wzkchem5 发表于 2024-5-6 19:02
检查xtb是否安装正确，xtb相关的环境变量是否设置正确，xtb计算是否有报错

感谢老师指导！！我以为xtb已经包含在里边了，是我没有安装。。

DDT好好吃 发表于 2024-5-6 04:43
小白求教：请问前辈，我用出现图片中的错误是什么原因啊？

检查xtb是否安装正确，xtb相关的环境变量是否设置正确，xtb计算是否有报错

小白求教：请问前辈，我用出现图片中的错误是什么原因啊？

TMULYU 发表于 2021-11-17 10:47
你好，在使用改程序在windows下运行aip构象搜索的例子出现了如下错误   请问怎么解决
Error occurs: Recie ...

请问这个问题解决了吗？我也出现一样的问题

TMULYU 发表于 2021-11-17 10:47
你好，在使用改程序在windows下运行aip构象搜索的例子出现了如下错误   请问怎么解决
Error occurs: Recie ...

你好，请问你解决了吗？

TMULYU 发表于 2021-11-17 10:47
你好，在使用改程序在windows下运行aip构象搜索的例子出现了如下错误   请问怎么解决
Error occurs: Recie ...

请问后来解决了吗？我在linux装3.2和3.1版本都有这个问题，windows又没这个问题。

请问这个软件外接vasp的话，如同官方教程那样只设置20步是不是不太够呢？要做一个全局最优的体系的话，是不是至少要几千步呢？我猜外接vasp设置步数这样少的原因是不是因为vasp本身算的很慢（我尝试过别的全局势能面扫描软件外接vasp的，确实很慢）。