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求助:利用sob老师编写的Fortran代码计算原子电荷出现错误

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zcw
发布时间: 2021-11-4 15:43

正文摘要:

本帖最后由 zcw 于 2021-11-4 16:12 编辑 读了sob老师的博文“将GROMACS的原子电荷信息读入VMD的方法”。我尝试利用sob老师的Fortran来计算电荷,可是显示有错误:Error in finding #molblock。 我也更改了代码 ...

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zcw 发表于 Post on 2021-11-4 16:27:10
sobereva 发表于 2021-11-4 16:16
4.5.5那么老的版本兼容不了很正常,你得根据那个版本的gmxdump给出的信息修改程序,要么用较新的GROMACS版 ...

好的,sob老师
sobereva 发表于 Post on 2021-11-4 16:16:20
4.5.5那么老的版本兼容不了很正常,你得根据那个版本的gmxdump给出的信息修改程序,要么用较新的GROMACS版本,诸如2018

如果要求不高,直接用GROMACS产生pqr文件载入VMD也可以
zcw 发表于 Post on 2021-11-4 16:13:31
snljty 发表于 2021-11-4 15:52
Fortran写的不叫脚本。用解释器而不(直接)用编译器的才叫脚本。
不提供你的gromacs版本和测试文件,估计 ...

好的,谢谢你的提醒,我用的是gromacs-4.5.5版本,测试文件太大上传不了。
snljty 发表于 Post on 2021-11-4 15:52:13
Fortran写的不叫脚本。用解释器而不(直接)用编译器的才叫脚本。
不提供你的gromacs版本和测试文件,估计没法解决。毕竟卢老师肯定测过至少测试文件是没问题的。

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