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求助:swiss-model建模,两端缺少残基如何补齐?

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发布时间: 2021-11-9 13:03

正文摘要:

我在swiss-model同源建模,然后发现开始和最后各缺失100多残基。然而需要缺失残基的部分。如何通过其他方法补齐残基

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wendao 发表于 Post on 2021-11-30 14:39:29
alphafold2
boychuan 发表于 Post on 2021-11-23 11:05:17
tanyingjia 发表于 2021-11-10 12:39
Okay, I probably understand what you mean, I'll try it。Thanks!

how to try ,can you explain in detail ?
tanyingjia 发表于 Post on 2021-11-10 12:39:48
Okay, I probably understand what you mean, I'll try it。Thanks!
rpestana94 发表于 Post on 2021-11-9 21:52:49
you can get it by homology modeling, you can get the same structure you get from the modeling as template and get a new structure, using modeller or swiss-model to model that parts and bind together
tanyingjia 发表于 Post on 2021-11-9 13:57:32
嗯嗯,因为我确实需要末端770多-800号残基,对接小分子
k64_cc 发表于 Post on 2021-11-9 13:25:32
开始和结束的部分不一定能构成有意义的二级结构,你看看PDB给的蛋白质结构,要是缺失的部分不影响整体结构就当没看见得了。

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