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怎样在gromacs里安装一个新的molecular simulation package?

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发布时间: 2021-11-10 08:57

正文摘要:

本人模拟小白,gromacs文件夹里包含了很多命令,比如grompp,请问怎样安装一个新的命令或者说模拟包呢?

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15589655705 发表于 Post on 2021-12-16 14:26:19
snljty 发表于 2021-11-10 11:32
不需要,直接编译gromacs本身即可。看卢老师博文《GROMACS的安装方法(含全程视频演示)》http://bbs.keins ...

老师您好,我上传了所有的文件,请您看下这个包该怎么用呢谢谢!
15589655705 发表于 Post on 2021-12-16 14:25:12
sobereva 发表于 2021-11-11 04:40
提供这个源代码的人应当写了安装方式说明才对,如果没写最好直接发邮件问作者,在这里谁也不清楚这包是怎么 ...

sober老师您好,我上传了所有的文件,麻烦您看下该怎么用这个包,谢谢!
lyj714 发表于 Post on 2021-11-11 17:00:53
本帖最后由 lyj714 于 2021-11-11 17:04 编辑

你可以看作者提供的g_temperature.cpp中有没有main函数,如果有,就表明这是个外置gromacs工具,直接编译的时候链接你系统上已经安装了的gromacs路径下的lib目录下的.so库就行了。注意你系统的gromacs版本一定要符合他给的版本要求。一般别人提供工具肯定有编译方式,就比如makefile文件
sobereva 发表于 Post on 2021-11-11 04:40:20
提供这个源代码的人应当写了安装方式说明才对,如果没写最好直接发邮件问作者,在这里谁也不清楚这包是怎么回事
15589655705 发表于 Post on 2021-11-10 19:20:54
snljty 发表于 2021-11-10 11:32
不需要,直接编译gromacs本身即可。看卢老师博文《GROMACS的安装方法(含全程视频演示)》http://bbs.keins ...

请问,我这里linux版和win版的gromacs都有,具体怎么把这段代码编译为GROMACS的内置模块呢,请您解答一下,谢谢!
snljty 发表于 Post on 2021-11-10 11:32:49
本帖最后由 snljty 于 2021-11-10 20:22 编辑

不需要,直接编译gromacs本身即可。看卢老师博文《GROMACS的安装方法(含全程视频演示)》http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html
抱歉之前没看清你是要添加新的模块,抽时间回复。

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