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求助,gfortran编译器

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发布时间: 2021-11-15 10:48

正文摘要:

之前有看到orca此类错误 后面我查了,这个账号下是有这个编译器,不知道为什么还是报同样的错误,小白救助!!!

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snljty2 发表于 Post on 2022-6-26 15:11:53
bluewhale 发表于 2022-6-26 10:47
openmpi 4.1.1是如何安装的?

先装gfortran,剩下的参考卢老师博文量子化学程序ORCA的安装方法
abin 发表于 Post on 2022-6-26 12:21:01
bluewhale 发表于 2022-6-26 10:47
openmpi 4.1.1是如何安装的?

试试这个方案.

http://bbs.keinsci.com/thread-26418-1-1.html

bluewhale 发表于 Post on 2022-6-26 10:47:35
openmpi 4.1.1是如何安装的?
doublehs 发表于 Post on 2022-6-26 09:49:39
进击的zhq 发表于 2021-11-16 18:12
我一开始用的是orca501配套的是mpi4.1.1,就是串行可以,并行不行,后面我又重新卸了,换了orca421配mpi314 ...

我的也出现这样的问题,请问最后是怎么解决的呢?谢谢
sobereva 发表于 Post on 2021-11-15 23:32:54
你先确保串行计算能运行成功。
如果只有并行不行,换其它任务,看是否也都不成功。都不成功就是MPI库的问题,重新编译OpenMPI再试,并且确保当前激活的MPI库(mpirun命令对应的)就是这个OpenMPI。本来这个跟gfortran有没有就没有任何必然的关系。
abin 发表于 Post on 2021-11-15 18:17:11
本帖最后由 abin 于 2021-11-15 23:17 编辑
进击的zhq 发表于 2021-11-15 17:14
你好,假如我已经有mpi会冲突吗?

应该没有关系。

你自己试试呗。

我没有你的测试环境,没法测试。
补充一下,
我自己用的集群上, 有多种MPI, 多种版本ORCA.

上文提到的ORCA方案, 测试可用, centOS7 centOS8 centOS Stream均可用.
不支持centOS6.
理论上, 能安装singularity 3.6以上版本的Linux系统, 均可以使用.

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进击的zhq + 3 谢谢

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进击的zhq 发表于 Post on 2021-11-15 17:14:25
abin 发表于 2021-11-15 13:51
如果你确认你的输入文件没有问题,
可以试试如下的版本.

你好,假如我已经有mpi会冲突吗?
abin 发表于 Post on 2021-11-15 13:51:06
如果你确认你的输入文件没有问题,
可以试试如下的版本.

链接: https://pan.baidu.com/s/113XqRATBvIcmMv9JJAOCag 提取码: 9ttm

## Installation
yum/dnf -y install singularity
mkdir $HOME/bin
cp orca.v5.0.1-openmpi-v4.1.1-hpc4you.SIF $HOME/bin
mv $HOME/bin/orca.v5.0.1-openmpi-v4.1.1-hpc4you.SIF $HOME/bin/orca5

## Run calculations.
orca5 Your-Input-File > Your-Output-File &

No need to install any MPI on your server.

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ggdh + 5 666,singularity小白杀手

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