bluewhale 发表于 2022-6-26 10:47 先装gfortran,剩下的参考卢老师博文量子化学程序ORCA的安装方法 |
bluewhale 发表于 2022-6-26 10:47 试试这个方案. http://bbs.keinsci.com/thread-26418-1-1.html |
openmpi 4.1.1是如何安装的? |
进击的zhq 发表于 2021-11-16 18:12 我的也出现这样的问题,请问最后是怎么解决的呢?谢谢 |
你先确保串行计算能运行成功。 如果只有并行不行,换其它任务,看是否也都不成功。都不成功就是MPI库的问题,重新编译OpenMPI再试,并且确保当前激活的MPI库(mpirun命令对应的)就是这个OpenMPI。本来这个跟gfortran有没有就没有任何必然的关系。 |
本帖最后由 abin 于 2021-11-15 23:17 编辑 进击的zhq 发表于 2021-11-15 17:14 应该没有关系。 你自己试试呗。 我没有你的测试环境,没法测试。 补充一下, 我自己用的集群上, 有多种MPI, 多种版本ORCA. 上文提到的ORCA方案, 测试可用, centOS7 centOS8 centOS Stream均可用. 不支持centOS6. 理论上, 能安装singularity 3.6以上版本的Linux系统, 均可以使用. |
参与人数Participants 1 | eV +3 | 收起 理由Reason |
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进击的zhq | + 3 | 谢谢 |
abin 发表于 2021-11-15 13:51 你好,假如我已经有mpi会冲突吗? |
如果你确认你的输入文件没有问题, 可以试试如下的版本. 链接: https://pan.baidu.com/s/113XqRATBvIcmMv9JJAOCag 提取码: 9ttm ## Installation yum/dnf -y install singularity mkdir $HOME/bin cp orca.v5.0.1-openmpi-v4.1.1-hpc4you.SIF $HOME/bin mv $HOME/bin/orca.v5.0.1-openmpi-v4.1.1-hpc4you.SIF $HOME/bin/orca5 ## Run calculations. orca5 Your-Input-File > Your-Output-File & No need to install any MPI on your server. |
参与人数Participants 1 | eV +5 | 收起 理由Reason |
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ggdh | + 5 | 666,singularity小白杀手 |
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