求助：VASP运行不了，似乎是mpi的问题？

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发布时间: 2021-11-16 21:09

求助VASP运行问题：如下采用pbs脚本提交任务，在输出的log文件开头是这些信息，vasp运行不成功，查了很多还是不清楚怎么解决，求助该怎么解决？ /opt/intel//impi/5.0.2.044/intel64/bin/mpirun: line 124: who ...

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abin 发表于 Post on 2021-11-17 14:20:03

Little-Extra 发表于 2021-11-17 12:37
对啊都是用的集群上root安装的程序。
不过我没改.bashrc 改了一下提交脚本，突然就弄好了，还是很懵

懵圈啥呀？

设定PATH ，
丢掉了$，
或者仅仅写了MPI的PATH ，
抹掉了系统的PATH ，
当然会提示whoami 都没有了。

这点技能，要仔细一点。
要不然，使用root很危险的。

Little-Extra 发表于 Post on 2021-11-17 12:37:48

abin 发表于 2021-11-17 12:14
你确定你的.bashrc 和别人的一样？
明显，PATH 搞错了嘛……

对啊都是用的集群上root安装的程序。
不过我没改.bashrc 改了一下提交脚本，突然就弄好了，还是很懵

abin 发表于 Post on 2021-11-17 12:14:44

Little-Extra 发表于 2021-11-17 12:10
为什么同样的脚本，别人账号可以运行，我这个不行，请问可能要修改什么地方？

你确定你的.bashrc 和别人的一样？
明显，PATH 搞错了嘛……

Little-Extra 发表于 Post on 2021-11-17 12:10:04

abin 发表于 2021-11-16 21:58
脚本未正确加载部分设定.
具体, 查询该平台的使用手册.

为什么同样的脚本，别人账号可以运行，我这个不行，请问可能要修改什么地方？

abin 发表于 Post on 2021-11-16 21:58:09

脚本未正确加载部分设定.
具体, 查询该平台的使用手册.

Little-Extra 发表于 Post on 2021-11-16 21:11:19

测试的INCAR, POSCAR, POTCAR, KPPOINT文件都是之前成功算完的输入文件

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