请教一下，盒子内某物质在Z方向的数量密度的物理意义是什么

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发布时间: 2021-11-21 20:05

本帖最后由牧生于 2021-11-21 21:11 编辑偶然想到这样一个问题，数量密度，是指单位体积内某种分子的数量吗？以冰文件2304.pdb进行模拟，完成模拟后的盒子体积约为 2.6×3×2.85=22.3 nm3 转为四点水模型后 ...

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L-jun 发表于 Post on 2023-3-17 17:11:02

本帖最后由 L-jun 于 2023-3-18 10:33 编辑

请问使用 mdp文件里写了 energygrps = ，freezegrps = ，freezedim = ，没看懂手册，这样这仨起作用了吗？

sobereva 发表于 Post on 2021-11-22 05:56:18

是单位体积内的粒子数目，没有特殊情况下，这里的粒子指所有原子和虚拟点。别忘了四点水模型有个虚拟点

参与人数 Participants 1	eV +2	收起理由 Reason
牧生	+ 2	原来是粒子数量，而不是分子数量

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