测试一个任务qsub总是被kill 但是nohup提交后台任务没有问题

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发布时间: 2021-11-21 21:43

查看日志显示core dump，但是用nohup mpirun -np 可以在后台正常运行，一旦使用pbs很快就会被杀掉unlimit -c -s 等已经limited 求指导

回复 Reply

鸭博 发表于 Post on 2024-8-30 10:09:42

singleman 发表于 2021-11-22 17:28
好的，感谢~~这种确实头疼除非遇到相同的毛病

您好您问题后来解决了吗因为我遇到的问题和您相似 qsub提交任务跑到一半就被杀死了，按理说也不该是编译器的问题，如果是编译器有问题的话一开始就跑不起来，挺纳闷的，所以想问问您用的什么方法解决的，麻烦您了

鸭博 发表于 Post on 2024-8-30 09:50:17

你好这个解决了吗我的是跑一半就给我杀死了

abin 发表于 Post on 2021-11-22 18:21:04

singleman 发表于 2021-11-22 17:28
好的，感谢~~这种确实头疼除非遇到相同的毛病

最简单的测试，
新建一个用户做测试。

同时，取消任何可能的全局设定。

singleman 发表于 Post on 2021-11-22 17:28:38

abin 发表于 2021-11-22 15:37
那你慢慢debug吧……

隔空猜，难以解决问题。

好的，感谢~~这种确实头疼

除非遇到相同的毛病

abin 发表于 Post on 2021-11-22 15:37:10

singleman 发表于 2021-11-22 13:54
感谢回复
是一个之前算过的任务，改了改INCAR参数重新提交，之前没问题，但昨天开始总是被杀。
其他任 ...

那你慢慢debug吧……

隔空猜，难以解决问题。

singleman 发表于 Post on 2021-11-22 13:54:03

abin 发表于 2021-11-22 10:30
猜测, PBS中关于MPI的部分, 设定错误.

感谢回复
是一个之前算过的任务，改了改INCAR参数重新提交，之前没问题，但昨天开始总是被杀。
其他任务提交暂时没问题，换了其他脚本还是一样的问题。
但是这个任务用nohup 在后台计算没有任何问题，已经得到了结果

abin 发表于 Post on 2021-11-22 10:30:05

猜测, PBS中关于MPI的部分, 设定错误.

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