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求助:amber14生成的拓扑文件出现错误

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发布时间: 2021-11-25 14:24

正文摘要:

各位老师,本人使用amber14中的tleap生成拓扑文件,结尾处如图所示 请问各位老师我该如何解决呢?

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fuchg 发表于 Post on 2021-11-30 10:20:59
目前这个错误算是解决了,因为我之前使用Gaussian 09计算的小分子和ADP是质子化之后的,随后我又重新计算了一遍没有经历质子化的结构,之后继续进行操作,目前没有出现报错,估计可能就是由于质子化导致小分子或者ADP的计算出现了一些问题,但是更具体的问题就不知道是什么情况了

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