sylar 发表于 2021-11-25 20:34 请问楼主，还是在A+B-------C+D的情况下 算吉布斯自由能 产物减去反应物的自由能 是不是意思是说 这里的产物和反应物的值 都是分开算再相加得到 而不是以整体优化再算单点能得到的 谢谢 |
xxzj 发表于 2021-12-3 11:56 烯烃少了两个氢，先把氢补上再算。此外注意检查总体系电荷，文献没有标出电荷不代表总体系一定是中性，一定要透彻理解这个体系，确定总体系电荷，再确定自旋多重度，再算 |
本帖最后由 xxzj 于 2021-12-3 18:58 编辑 wzkchem5 发表于 2021-11-25 22:02 老师，图片2中显示Ag离子和烯烃以及氧离子同时配位，但是不知道初猜结构在gaussview中如何绘制，试了几种但是优化后都不正确，附了其中一种自己的猜测，想请问老师，如果在gaussview中正确放置Ag离子的位置？ 
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wzkchem5 发表于 2021-11-25 22:02 明白了，谢谢您！ |
本帖最后由 wzkchem5 于 2021-11-25 15:04 编辑 sylar 发表于 2021-11-25 13:34 是的，过渡态就是过渡态，不能因为过渡态里的反应物分子也是完整的，就把过渡态也拆开算。另外，只有当你确定这个反应是单步、双分子反应时，才应该这么做。有的反应表面上看是A+B反应生成C+D，但实际是先生成非共价复合物AB，AB再反应生成C+D，也就是说其实是两步反应。此时应当再多做一个计算，看看AB的自由能是否低于A和B的自由能之和，如果确实低于，那么AB是休眠种，计算时应当用过渡态的自由能减去AB的自由能，而不是减去A和B的自由能之和。 |
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| + 3 | 谢谢 |
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wzkchem5 发表于 2021-11-25 19:52 谢谢老师，还有点不明白，《谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生》中说双分子的反应要分别计算反应物自由能，那我需要做的是反应物和产物的自由能分开算再相加，过渡态以一个整体来看，是这样吗？ |
| 谢谢老师，请问反应物和产物的自由能要分开算再相加吗 |
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永远按照整体算，因为两个分子之间即使不成键，彼此也是有相互作用的，分开算会漏算这一部分相互作用 另外建议仔细阅读http://sobereva.com/414 |
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