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为什么我用glycam网页构建的这个多糖的力场网页一直停留在minimization呢

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邱美佳

发布时间: 2021-11-30 11:04

正文摘要:

为什么我用glycam网页构建的这个二糖的力场，网页一直停留在minimization呢？

回复 Reply

userrr 发表于 Post on 2025-3-13 11:31:07

你好，博主，我现在也遇到和你一样的问题，我也想用gromacs模拟糖的力场，但是我用ambertools的时候转化我自己的mol2文件时显示找不到原子类型，我看了看和力场文件的原子类型是没有对上，我现在是想将自己的mol2文件转换成ambertools能够识别的文件，有什么好的方法和软件吗，我的mol2的文件是avogadro生成的，谢谢啦
只能用网页在线构建吗，有没有什么其他的办法呀，谢谢啦

tjuptz 发表于 Post on 2021-11-30 20:04:29

换个时间再试一下，网站不太稳定

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