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genmer生成xyz文件后调用Gaussian无法打开molclus

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发布时间: 2021-12-1 09:20

正文摘要:

本帖最后由 zhuyk 于 2021-12-1 09:21 编辑 所有参数已经根据帖子里进行了设置,在添加环境变量后出现了几个新的文件,如图3所示,删除不掉。同时molclus闪退,重启后可以打开molclus,但是无法运行高斯软件。之 ...

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sobereva 发表于 Post on 2021-12-3 03:45:12
zhuyk 发表于 2021-12-2 11:44
我现在一直显示的运行,已经运行了一整天了,然后不断生成chk文件,请问下这种状态是还没结束计算吗,然 ...

谁也没法猜。仔细看屏幕的提示判断,看不懂就截图

明摆着不可能设成g09w.exe,不要做毫无意义的事。此文红字都写得超级清楚了
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html



zhuyk 发表于 Post on 2021-12-2 16:10:41
Akaiconan 发表于 2021-12-2 15:50
那你把路径改成g09.exe了吗?cmd窗口中结构一个接着一个开始计算了吗?
我师妹可能遇到了和你类似的问题 ...

已经设置成g09.exe了,然后cmd一直显示的running,生成的文件不断更新,但是isomer一直没有数据出现
Akaiconan 发表于 Post on 2021-12-2 15:50:57
zhuyk 发表于 2021-12-2 11:44
我现在一直显示的运行,已经运行了一整天了,然后不断生成chk文件,请问下这种状态是还没结束计算吗,然 ...

那你把路径改成g09.exe了吗?cmd窗口中结构一个接着一个开始计算了吗?
我师妹可能遇到了和你类似的问题。她当时的路径也是g09w.exe,molclus一直停在第一个结构。改成g09.exe很快就算完了。轨迹也存在了isomers.xyz中了。
至于chk文件,我看你的ibkchk设定为0,应该会自动删除才对。
zhuyk 发表于 Post on 2021-12-2 11:44:52
Akaiconan 发表于 2021-12-2 08:29
仔细社长的帖子,需要把路径设置到g09.exe结束,设置成g09w.exe打开molclus只会打开高斯软件,不会进行计算 ...

我现在一直显示的运行,已经运行了一整天了,然后不断生成chk文件,请问下这种状态是还没结束计算吗,然后isomers一直没有数据
Akaiconan 发表于 Post on 2021-12-2 08:29:01
本帖最后由 Akaiconan 于 2021-12-2 08:56 编辑

仔细社长的帖子,需要把路径设置到g09.exe结束,设置成g09w.exe打开molclus只会打开高斯软件,不会进行计算。我的理解是molclus是后台运行的,你关闭它的cmd界面它还是在后台运行。
要想关闭molclus,打开任务管理器,进程中你就能看见某一个link(如l502)正在运行,kill掉这个进程,才算把molclus彻底关闭。然后所有gau和gxx开头的文件就能删掉。

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