假设来自构象权重问题，可以用molclus做构象搜索，然后用Multiwfn绘制构象权重平均的红外光谱，参看
构型和构象搜索程序Molclus主页：http://www.keinsci.com/research/molclus.html
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
gentor：扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html
将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-20063-1-1.html
使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html

使用Multiwfn绘制构象权重平均的光谱
http://sobereva.com/383（http://bbs.keinsci.com/thread-6186-1-1.html）


也有可能和体系状态有关，有可能你需要对凝聚相体系跑动力学得到红外光谱，而不适合只用单个分子来算。

没更具体信息没法说

这个看起来不是多了峰，而是计算的峰不如实验的宽。实验图可以看作是两个重叠很大的宽峰和一个窄峰，但一般计算红外的方法不能分别计算每个峰的峰宽，画图的时候必须把每个峰设成一样宽，所以才和实验对不上。
可以看一下你用的构象是不是分子的唯一构象，如果不是，应该做构象搜索，对每个构象都做红外计算，再把结果做Boltzmann平均。
此外注意所谓的消虚频不是把虚频凭空消灭掉，而是把虚频变成一个很小的实频。谐振近似下，非线性的N原子分子的振动频率数目永远是3N-6个，不可能凭空去掉一个。