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求助,gromacs算水本身的溶剂化自由能报错

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发布时间: 2021-12-7 21:05

正文摘要:

在使用gromacs里的spce水纯溶剂计算一个spce水分子的溶剂化自由能时(按照刚性水算的)。在进行能量最小化时就出现如下图1报错:(大概意思就是致命错误: 拓扑结构的 [molecules] 部分指定了多个具有 [settles] 块 ...

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gorky 发表于 Post on 2021-12-8 10:33:18
sobereva 发表于 2021-12-8 08:46
这么算没问题
对水这么关心,应当用目前最好的水模型OPC来算,至少也用同为三点水模型的OPC3

懂了,谢谢sob老师
sobereva 发表于 Post on 2021-12-8 08:46:31
这么算没问题
对水这么关心,应当用目前最好的水模型OPC来算,至少也用同为三点水模型的OPC3

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