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gromacs:em之后最后一组材料会散开

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发布时间: 2021-12-8 11:02

正文摘要:

本帖最后由 王珑霏 于 2021-12-14 11:08 编辑 为什么在跑完em以后,如果不把材料冻住的话,最后一组材料会散开呢,一共使用了四组材料,前三组只是发生了变形变化,但是最后一组会跟图片里一样散开,图片中的材料 ...

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王珑霏 发表于 Post on 2021-12-15 08:57:17
Entropy.S.I 发表于 2021-12-8 11:20
使用了半各向同性控压,未对X/Y方向执行压力耦合。提取pres_zz或许能达到期望的1bar压强。
猜测你这是界面 ...

谢谢您的答复!
Entropy.S.I 发表于 Post on 2021-12-8 11:20:28
使用了半各向同性控压,未对X/Y方向执行压力耦合。提取pres_zz或许能达到期望的1bar压强。
猜测你这是界面体系,界面平行于XY平面,由于界面张力,X/Y方向的压力张量分量很负,导致总压很负,这是正常现象,再模拟久一些就可以用这些压力数据计算界面张力

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