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膜和蛋白体系加电压,请问电场的数值是用电压值除以体系盒子的尺寸吗?

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发布时间: 2021-12-16 14:42

正文摘要:

我的体系是四个蛋白和一个混合生物膜,要给体系z方向加5V电压,用的平台是gromacs。gromacs加电压的方式是在mdp文件中加电场,单位是V/纳米。盒子尺寸我是从gro文件末尾读出来的。想请教两个问题: 1.如果盒子的尺 ...

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五月雨 发表于 Post on 2024-3-21 01:16:06
sobereva 发表于 2021-12-16 15:18
1、2是

3 先不加电场或者只加非常小的电场再试。如果只有大电场时候崩溃,把步长设很小再试

请问sob老师,0.5V/nm的电场强度是不是太高了,现实实验中会用到这么高的场强吗
bingzan 发表于 Post on 2021-12-16 15:23:30
sobereva 发表于 2021-12-16 15:18
1、2是

3 先不加电场或者只加非常小的电场再试。如果只有大电场时候崩溃,把步长设很小再试

明白啦,谢谢老师指点!
sobereva 发表于 Post on 2021-12-16 15:18:53
1、2是

3 先不加电场或者只加非常小的电场再试。如果只有大电场时候崩溃,把步长设很小再试

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