最小能量路径搜索软件MEPsearcher

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发布时间: 2016-2-19 15:56

本帖最后由 chenxin199261 于 2016-2-19 16:01 编辑简介 MEPsearcher基于string计算方法，用于搜索二维全局离散势能面上的能量最小路径Mminimun Energy Path(MEP),通常MEP可以完整揭示反应机理。过渡态、活化能 ...

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chenxin199261 发表于 Post on 2016-2-20 12:44:35

smutao 发表于 2016-2-19 23:40
高维的版本有没有？
比如要找电子密度分布的Maximum Electron Density Path我猜Sob的Multiwfn里应该有这 ...

高维的暂时没有，很容易改的。可以用一个二维数组存X,Y,Z，而不是我那样分别对X，Y操作。
我没做高维的，因为高维的路径无法可视化，意义不大。

chenxin199261 发表于 Post on 2016-2-20 12:42:26

sobereva 发表于 2016-2-20 01:31
那个是Multiwfn的产生键径。
具体来说是先用牛顿法根据初猜搜索到鞍点，然后由此跟踪密度下降最快路径。 ...

我的不用找到极值点也可以得到那个路径，比我我初猜的那样，给出一条线。这个是string方法的一个好处。
NEB好像必须锁定两个极小值点。

sobereva 发表于 Post on 2016-2-20 01:31:45

smutao 发表于 2016-2-19 23:40
高维的版本有没有？
比如要找电子密度分布的Maximum Electron Density Path我猜Sob的Multiwfn里应该有这 ...

那个是Multiwfn的产生键径。
具体来说是先用牛顿法根据初猜搜索到鞍点，然后由此跟踪密度下降最快路径。这类似于高斯等程序产生IRC的算法。LZ的则类似于第一性原理程序支持较多的NEB方法，已知极小点，一下子就得到IRC，原理上可以用于任意维。

smutao 发表于 Post on 2016-2-19 23:40:45

本帖最后由 smutao 于 2016-2-19 23:42 编辑

高维的版本有没有？
比如要找电子密度分布的Maximum Electron Density Path我猜Sob的Multiwfn里应该有这个功能

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