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24条多肽链的分子动力学模拟,在运行NPT步骤时,出现以下报错,麻烦老师们看看,非...

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发布时间: 2021-12-27 15:32

正文摘要:

是什么原因会出现这种报错呢?还望老师们解答一下

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CMMCMM 发表于 Post on 2021-12-28 14:48:36
sobereva 发表于 2021-12-27 16:32
-ntmpi 1跑一阵,等体系大致平衡了,再切换回默认的或者效率最佳的并行方式继续跑

好的,已经解决啦,非常感谢
CMMCMM 发表于 Post on 2021-12-28 14:48:06
喵星大佬 发表于 2021-12-27 16:10
先用-ntmpi 1跑,体系太不均匀不好做域分解

好的,已经解决啦,非常感谢
CMMCMM 发表于 Post on 2021-12-28 14:47:39
chenbq18 发表于 2021-12-27 15:56
初始结构不合理 或者可以看看mdp参数设置

好的,已经解决啦,非常感谢
sobereva 发表于 Post on 2021-12-27 16:32:35
-ntmpi 1跑一阵,等体系大致平衡了,再切换回默认的或者效率最佳的并行方式继续跑
喵星大佬 发表于 Post on 2021-12-27 16:10:06
先用-ntmpi 1跑,体系太不均匀不好做域分解
chenbq18 发表于 Post on 2021-12-27 15:56:48
初始结构不合理 或者可以看看mdp参数设置

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