计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

计算结果提示原子数量超出范围

查看数: 22735 | 评论数: 13 | 收藏 Add to favorites 1
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2016-2-22 16:42

正文摘要:

计算Ir配合物的基态优化,采用6-31G(d)基组,结果log文件显示错误如下(图1): Standard basis: 6-31G(d) (6D, 7F) Atomic number out of range for 6-31G basis set. Error termination via Lnk1e in /home ...

回复 Reply

lastzealot 发表于 Post on 2016-2-22 20:39:59
brothers 发表于 2016-2-22 17:12
不是原子“数量”,是原子序号。6-31g*对Ir没有定义。换个基组,或者使用混合基组。

bingo
yezhonghua 发表于 Post on 2016-2-22 19:56:53
sobereva 发表于 2016-2-22 19:54
对Ir你既得定义赝势基组也得定义赝势,是两回事
空行前定义的是各个元素的赝势基组,空行后,也就是你红 ...

谢谢老师指点!我去尝试一下!
sobereva 发表于 Post on 2016-2-22 19:54:03
yezhonghua 发表于 2016-2-22 19:49
sobereva老师,谢谢您的指导!
按照您的指导和帖子的内容:
我的理解如下图1和图2,您看是否正确。定义 ...

对Ir你既得定义赝势基组也得定义赝势,是两回事
空行前定义的是各个元素的赝势基组,空行后,也就是你红字标的,必须写,这里定义的是Ir的赝势
而且gen必须改成genecp,否则Ir光有赝势基组而不设定赝势,优化结果明显不合理,周围原子往往会向Ir中心严重坍塌。
sobereva 发表于 Post on 2016-2-22 18:16:47
yezhonghua 发表于 2016-2-22 18:08
请问我这样使用混合机组对不对,定义完后,最后的Ir定义完后,分隔符****和下面的数字之间需要空一行么( ...


后面那一坨gview自动产生的没用的连接关系都删掉
是“基组”不是“机组”

你只对Ir定义了赝势基组,没定义赝势,结果显然不对。
应当写genecp,末尾空一行写
C H N
6-31G*
****
Ir
lanl2DZ
****

Ir
lanl2DZ

你再仔细看sobereva.com/60里的说明和例子。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
暗黑烧酒小圆 + 3 好物!

查看全部评分 View all ratings

yezhonghua 发表于 Post on 2016-2-22 17:54:48

太感谢了,我猜文献也是这个意思。谢谢!我试试看能不能行!
yezhonghua 发表于 Post on 2016-2-22 17:50:37
brothers 发表于 2016-2-22 17:12
不是原子“数量”,是原子序号。6-31g*对Ir没有定义。换个基组,或者使用混合基组。

如何使用混合机组?文献上对于苯基嘧啶采用的是6-31g(d),对于Ir采用的是LANL2DZ优化。
谢谢!
小范范1989 发表于 Post on 2016-2-22 17:49:48
yezhonghua 发表于 2016-2-22 17:47
文献03年的,对于苯基嘧啶采用的是6-31g(d),对于Ir采用的是LANL2DZ优化。请问,这是分开优化么,那机 ...

http://sobereva.com/60
yezhonghua 发表于 Post on 2016-2-22 17:47:12
小范范1989 发表于 2016-2-22 16:54
我不太懂哈,你的这个Ir也用6-31g*机组?是不是应该分机组优化?

文献03年的,对于苯基嘧啶采用的是6-31g(d),对于Ir采用的是LANL2DZ优化。请问,这是分开优化么,那机组那边怎么去选择?谢谢
brothers 发表于 Post on 2016-2-22 17:12:28
不是原子“数量”,是原子序号。6-31g*对Ir没有定义。换个基组,或者使用混合基组。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

小范范1989 发表于 Post on 2016-2-22 16:54:57
我不太懂哈,你的这个Ir也用6-31g*机组?是不是应该分机组优化?

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 22:30 , Processed in 4.294946 second(s), 27 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list