ABQTrap 发表于 2024-5-3 08:55 jobiph是二进制文件,需要用专门的工具进行相互转化(类似于gaussian的chk和fchk),工具默认不编译,需要在cmake时加上参数-DTOOLS=ON。 另外,molcas官方目前主推h5数据格式,jobiph格式将来会被替代,因此缺少维护。主要存在两个问题,大概至今也没有彻底解决: 1. 如果做多步rasscf计算,并且活性空间发生了变化,那么jobiph会被破坏 2. molcas 8.0以后的jobiph文件增加了一些内容,但是转化工具没有更新,如果转化报错(依赖于molcas版本),需要参照保存jobiph文件的molcas源代码,把缺少的内容补充到转化工具里。 要避免上述问题,建议用rasorb(已经是格式化的文本文件),或者用h5 |
参与人数Participants 1 | eV +1 | 收起 理由Reason |
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ABQTrap | + 1 | 谢谢 |
lijingbai2009 发表于 2022-5-11 01:46 老师,请问如何打开jobiph文件呢?直接双击不能打开,提示是二进制文件之类的信息。谢谢 |
lijingbai2009 发表于 2022-5-11 01:46 好的,非常感谢哈~ |
好的,非常感谢哈~ |
1. RasOrb是平均化的轨道,RasOrb.1是基态的轨道,用那个影响不大,因为都要先通过CASSCF收敛后通过内部文件JobIPh(记不太清了)传送到CASPT2计算。 2. 建议使用RICD,cholesky是老版本的关键词。Molcas的主要问题是并行效率不高,通常都是跑单核。。。而且如果使用服务器计算的话,建议把任务拷贝到本地机器的文件夹运行。像在SLURM的/scratch里跑,稍大点梯度的计算就有很大延迟。 3. COPY 和命令行的cp差不多。说明书里有的是特殊用法,比如保存之前计算好的不同自旋的轨道文件,然后计算旋轨耦合常数,有的只是为了保存一下轨道文件。JobIPH和RasOrb区别在于JobIPH包含CI coefficient而RasOrb只有MO coefficient。所以JobIPH理论上收敛更快,重复性更好。 |
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