gmx mmpbsa使用前，是否需要手动预处理模拟轨迹

查看数: 3421 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 1

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2022-1-7 12:49

本帖最后由 a9471163 于 2022-1-7 13:05 编辑各位老师，我想使用已发表的gmx mmpbsa工具（https://doi.org/10.1021/acs.jctc.1c00645）进行计算，我的体系是周期性二维COF和其他有机小分子，但我的COF在模拟过程 ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2022-1-8 06:01:30

你这种体系完全不需要MM/PBSA，因为根本没有溶剂
GROMACS里设置能量组，直接提取COF和小分子之间的作用能就完了

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register