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中间体优化,得到的结构式另一个中间体,如果修改输入文件该如何修改?

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发布时间: 2022-1-7 16:27

正文摘要:

求问,使用Gaussian 09优化PNP催化剂上含甲酸的结构,N上的H一直拔不掉应该怎么做。比如我设好甲酸HCOOH,O…H……N距离分别为0.9埃,和2.8埃。最后H和N还是连上的。这种应该如何才可以优化出来啊?谢谢大家(结构如 ...

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zhining 发表于 Post on 2022-1-7 17:24:00
wzkchem5 发表于 2022-1-7 16:31
做一个柔性扫描,验证一下H是不是只能在N上。可能H在甲酸上的结构根本不存在,不是你优化方法的问题,而是 ...

嗯嗯,我先尝试一下,谢谢。之前做过刚性扫描
wzkchem5 发表于 Post on 2022-1-7 16:31:58
做一个柔性扫描,验证一下H是不是只能在N上。可能H在甲酸上的结构根本不存在,不是你优化方法的问题,而是客观上不存在

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