oniom计算的结构怎样分析轨道

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发布时间: 2022-1-12 14:55

各位老师，我用oniom去计算的结构，想分析他的轨道。参考计算化学公社里的一个帖子“ONIOM计算后如何在fchk文件中保存轨道信息” （链：http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 3&fromuid=22723”，我的结构分为两 ...

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fy_111 发表于 Post on 2022-5-30 11:01:57

本帖最后由 fy_111 于 2022-5-30 22:27 编辑

sobereva 发表于 2022-1-14 13:05
看屏幕上的提示
继续回车就完了

老师，我用formchk -MS 输出了fchk文件后，在multiwfn里一直回车，到最后一个原子就闪退了，这个情况怎么解决呢，是因为文件太大了吗（1.05GB）

二次编辑：这个问题已经解决了，换了3.8版本的multiwfn就可以了，谢谢老师上面提供的方法。

fy_111 发表于 Post on 2022-5-30 10:29:09

SuXXXX 发表于 2022-1-14 19:07
好的！！谢谢Sob老师耐心解答！解决了！

我一直回车到最后一个原子，然后multiwfn就闪退了，你有遇到这种情况吗？

天天121 发表于 Post on 2022-4-12 13:29:44

sobereva 发表于 2022-4-12 12:38
graphics - representation里用恰当的选择语句只显示要显示的区域，看
VMD里原子选择语句的语法和例子
...

好的老师我再去试一下

sobereva 发表于 Post on 2022-4-12 12:38:24

天天121 发表于 2022-4-12 12:06
试了一下老师周围还是有别的分子十分的不美观

graphics - representation里用恰当的选择语句只显示要显示的区域，看
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

天天121 发表于 Post on 2022-4-12 12:06:08

试了一下老师周围还是有别的分子十分的不美观

2022-04-12_120503.png (443.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 42)

天天121 发表于 Post on 2022-4-12 11:54:19

心向暖阳发表于 2022-4-12 10:55
当然可以你用fchk导出cube应该就直接是的，不用其他操作了

好的老师我去试试

心向暖阳 发表于 Post on 2022-4-12 10:55:14

天天121 发表于 2022-4-12 10:50
老师如何把周围LOW层的分子都去了呢还有为什么这样得到的fchk文件不能利用您写的制作艺术级轨道那篇论 ...

当然可以你用fchk导出cube应该就直接是的，不用其他操作了

天天121 发表于 Post on 2022-4-12 10:50:15

sobereva 发表于 2022-1-14 13:05
看屏幕上的提示
继续回车就完了

老师如何把周围LOW层的分子都去了呢还有为什么这样得到的fchk文件不能利用您写的制作艺术级轨道那篇论文去制作好看的轨道图片

SuXXXX 发表于 Post on 2022-1-14 19:07:39

sobereva 发表于 2022-1-14 13:05
看屏幕上的提示
继续回车就完了

好的！！谢谢Sob老师耐心解答！解决了！

sobereva 发表于 Post on 2022-1-14 13:05:54

SuXXXX 发表于 2022-1-14 08:56
Sob老师，再次请您帮忙看看，我回车以后是这样的，还是不能够进行下一步操作

看屏幕上的提示
继续回车就完了

sobereva 发表于 Post on 2022-1-14 06:32:18

SuXXXX 发表于 2022-1-13 20:32
好的好的！我看了下如何加图。
Sob老师，如果不管这个警告的话，我把这个fchk文件拖入Multiwfn软件中， ...

直接按回车无视

sobereva 发表于 Post on 2022-1-13 15:08:50

SuXXXX 发表于 2022-1-13 15:08
谢谢Sob老师回复，我还是遇到了问题，请Sob老师帮忙指点一下。
我用了formchk - MS 1-RC-m-3-sta-HF.chk ...

甭管

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