这根本就不是该Gaussian干的事
直接让GROMACS在恰当的力场下做能量极小化就完了

令人费解的是，为何要用高斯ONIOM来优化蛋白质结构，ONIOM不是用来在QM/MM的吗？如果想做动力学，直接用对接的结构即可，为什么要用gaussview来保存结构。