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过渡态搜索结果有两个虚频,如何消掉其中一个?

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发布时间: 2022-2-12 16:06

正文摘要:

各位老师好,我用Gaussian09搜索如下反应(N上的H转移到O上,C与N成键)的过渡态时,结果出现了两个虚频:第一个-1593是对应于反应路径的,第二个-962对应于甲基上3个氢原子的旋转。根据sob老师的帖子http://soberev ...

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yaoyuan0711 发表于 Post on 2022-2-14 11:25:02
喵星大佬 发表于 2022-2-14 11:17
不用特意纠结那个玩意,用了,可能有改进,不用,影响也不大,定性还是定量基本上都轮不到那点热力学校正 ...

好的,谢谢您的指导
喵星大佬 发表于 Post on 2022-2-14 11:17:32
本帖最后由 喵星大佬 于 2022-2-14 11:19 编辑
yaoyuan0711 发表于 2022-2-14 11:12
谢谢!但还有一个问题,b3lyp/def2tzvp能找到频率校正因子,def2svp好像没有。。。

不用特意纠结那个玩意,用了,可能有改进,不用,影响也不大,定性还是定量基本上都轮不到那点热力学校正量上的微小影响,其他能产生大的多的误差的地方注意好才是真的
yaoyuan0711 发表于 Post on 2022-2-14 11:12:07
fatpig 发表于 2022-2-14 10:32
理论上就是这样。

我们组以前都是用pople+小赝势,自从换了def2-svp/def2-tzvp,嘿,真香...

谢谢!但还有一个问题,b3lyp/def2tzvp能找到频率校正因子,def2svp好像没有。。。
喵星大佬 发表于 Post on 2022-2-14 10:50:09
fatpig 发表于 2022-2-14 10:32
理论上就是这样。

我们组以前都是用pople+小赝势,自从换了def2-svp/def2-tzvp,嘿,真香...

瓜丝用户,一般目的(反应能势垒之类的,包括激发态),DFT,基本上6-31G*(*),def-TZVP,def2-TZVP三个级别就差不多了,对于含阴离子的最多也是最多到may/jul-cc-pVTZ,基本用不到其他的基组
fatpig 发表于 Post on 2022-2-14 10:32:21
yaoyuan0711 发表于 2022-2-14 08:49
一换基组就成了,不过我得把所有计算都重新算了。。。
是pople基组没有def2系列的基组构建的好吗?so ...

理论上就是这样。

我们组以前都是用pople+小赝势,自从换了def2-svp/def2-tzvp,嘿,真香...

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yaoyuan0711 发表于 Post on 2022-2-14 10:09:23
喵星大佬 发表于 2022-2-14 09:50
我的意思是,如果体系所有都跟你现在这个东西这么大,用def2-tzvp去算去振动分析,也不是不能接受,基本 ...

好的,谢谢您的建议
喵星大佬 发表于 Post on 2022-2-14 09:50:07
本帖最后由 喵星大佬 于 2022-2-14 09:51 编辑
yaoyuan0711 发表于 2022-2-14 08:57
您意思是说对于我当前的体系,有一个额外的-962的虚频也能接受?因为原子数不多,想计算的更精确点,用了 ...

我的意思是,如果体系所有都跟你现在这个东西这么大,用def2-tzvp去算去振动分析,也不是不能接受,基本上这个大小的基组做到7,80个原子的振动分析/找过渡态之类的就会很吃力了,可以用def-tzvp,在瓜丝里写作tzvp,这个基组跟6-311G**基本差不多,稍微大一丢丢

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yaoyuan0711 发表于 Post on 2022-2-14 09:47:47
sai77 发表于 2022-2-14 09:35
内存设定是%mem=xxxGB

好的,谢谢您了,以前没注意这个问题
sai77 发表于 Post on 2022-2-14 09:35:02
yaoyuan0711 发表于 2022-2-14 08:54
感谢您的建议!我在输入文件一直写了%nprocshared=24,但是还是出现了您说的这种情况,这是什么原因?

内存设定是%mem=xxxGB

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yaoyuan0711 发表于 Post on 2022-2-14 08:57:50
喵星大佬 发表于 2022-2-14 08:53
这个基组相当大,尤其是振动分析会非常费劲,不过就这个结构来看还好体系不算大也不是完全不能接受就是了

您意思是说对于我当前的体系,有一个额外的-962的虚频也能接受?因为原子数不多,想计算的更精确点,用了较大的基组,后续用PWPB95/def2qzvpp计算单点、
喵星大佬 发表于 Post on 2022-2-14 08:53:39
这个基组相当大,尤其是振动分析会非常费劲,不过就这个结构来看还好体系不算大也不是完全不能接受就是了

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yaoyuan0711 发表于 Post on 2022-2-14 08:49:46
本帖最后由 yaoyuan0711 于 2022-2-14 09:00 编辑
fatpig 发表于 2022-2-12 16:34
基组换成 def2-tzvp 试试...

一换基组就成了,不过我得把所有计算都重新算了。。。
是pople基组没有def2系列的基组构建的好吗?sob老师在http://sobereva.com/336提到过这一点
yaoyuan0711 发表于 Post on 2022-2-14 08:48:37

谢谢!我按照您说的分别旋转+60度和-60度,-60度搜索出来虚频减小到190了,我应该继续旋转?

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