计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 单链DNA用gromacs生成拓扑文件报错

单链DNA用gromacs生成拓扑文件报错

查看数: 4206 | 评论数: 1 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

Tummy

发布时间: 2022-2-15 14:19

正文摘要:

Program: gmx pdb2gmx, version 2020.6-MODIFIED Source file: src\gromacs\gmxpreprocess\pdb2gmx.cpp (line 745) Fatal error: Atom 'HO5 in residue DA 1 was not found in rtp ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2022-2-16 10:46:29

你的截图和帖子文字里的报错完全不符，提问时交代清楚，不要有任何歧义

对于pdb里氢的原子名和rtp里不符的问题，加上-ignh

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register