sobereva 发表于 2022-2-17 08:26
如果晶体解析度够高，只优化氢就行了
你当前体系净电荷设为了+2，注意考虑这个的合理性。其它地方没显著 ...

好的，感谢社长指点

不是兔纸不是猫 发表于 2022-2-16 19:45
感谢回复，那也就是说我可以只优化氢，其他都不需要动是么？不需要全局优化是么？

我觉得是的，首先要保证你的晶体结构完整度和GooF值符合要求就好。

不是兔纸不是猫 发表于 2022-2-16 19:45
感谢回复，那也就是说我可以只优化氢，其他都不需要动是么？不需要全局优化是么？

如果晶体解析度够高，只优化氢就行了
你当前体系净电荷设为了+2，注意考虑这个的合理性。其它地方没显著问题
说什么“跑乱了”必须把截图贴出来，否则别人没法猜是什么情况

晓来雨过 发表于 2022-2-16 18:40
如果结构是单晶XRD得到的，那是不是可以固定非氢原子再做优化呢？

感谢回复，那也就是说我可以只优化氢，其他都不需要动是么？不需要全局优化是么？

如果结构是单晶XRD得到的，那是不是可以固定非氢原子再做优化呢？

wzkchem5 发表于 2022-2-16 16:49
是所有苯环都跑乱了吗？还是只有一部分跑乱了？
如果是一部分，具体是哪些苯环跑乱了？

全乱了，所以我感觉应该就是我哪里设置的不对

建议先用xtb预优化一下，再拿来DFT搞

不是兔纸不是猫 发表于 2022-2-16 07:58
非常感谢回复，已在一楼上传inp文件，如果可能烦请百忙之中指点一二，感激不尽！

是所有苯环都跑乱了吗？还是只有一部分跑乱了？
如果是一部分，具体是哪些苯环跑乱了？

wzkchem5 发表于 2022-2-15 21:50
检查一下是不是初始结构没有去除无序原子、没有加氢之类的。如果这方面没问题，把一些不重要的取代基用氢代 ...

非常感谢回复，已在一楼上传inp文件，如果可能烦请百忙之中指点一二，感激不尽！

sobereva 发表于 2022-2-16 10:10
直接上传个输入文件，你自己省得解释，别人也省得猜

仔细阅读

感谢社长批评，已在一楼上传inp文件，烦请社长百忙之中指点一二，非常感谢！

直接上传个输入文件，你自己省得解释，别人也省得猜

仔细阅读
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

检查一下是不是初始结构没有去除无序原子、没有加氢之类的。如果这方面没问题，把一些不重要的取代基用氢代替，跑一下试试

Eudaimonia 发表于 2022-2-15 20:08
你这个看起来比较像 MOF/COF 一类的东西，可能和这种用簇模型模拟表面不太一样；
你可以看看相关帖子有 ...

好的 同样非常感谢

不是兔纸不是猫 发表于 2022-2-15 20:00
感谢回复，但是我的这个感觉好像跟社长文章中描述还不是一类体系，可能我比较菜，理解有问题，我的铜簇是 ...

你这个看起来比较像 MOF/COF 一类的东西，可能和这种用簇模型模拟表面不太一样；
你可以看看相关帖子有没有类似的讨论；

Eudaimonia 发表于 2022-2-15 19:43
使用量子化学程序基于簇模型计算金属表面吸附问题
用簇模型的弊端在于：
• 需要合理考虑边界效应。 ...

感谢回复，但是我的这个感觉好像跟社长文章中描述还不是一类体系，可能我比较菜，理解有问题，我的铜簇是总共800多个原子，只有几十个铜原子在中心部分，周围一圈全是小分子配体，所以您说的这个给铜做饱和的问题处理方式跟社长这篇文章相似么？是类似体系么？