请问楼主,你知道怎么让idpp.py这个脚本正常运行吗?我这里显示好像是需要安装python,如果需要安装的话该怎么安装在vasp上呢? |
卡开发发 发表于 2022-2-16 10:53 老师你好,idpp.py这个脚本运行需要Python的程序,我怎么在vasp上安装python呢?安装哪个版本?我有点懵 |
您好,用您的脚本,出现loop到1000不收敛啊 |
静哥哥 发表于 2022-6-11 17:30 请教楼主这个问题最后怎么解决的呢 |
静哥哥 发表于 2022-6-11 11:12 我也遇到了这个问题,但是貌似非线性插点还是成功了 |
卡开发发 发表于 2022-6-11 11:41 好的,谢谢卡发老师,我在研究研究 |
静哥哥 发表于 2022-6-11 11:17 我这边用你的结构是能正常进行的,也许是python版本问题也可能是ase版本问题。你可以把主程序部分的try except结构去除,只留下try下面的部分看看报什么样的错误。这个程序只是提供一种解决思路,并不打算做完善。 |
卡开发发 发表于 2022-6-11 10:47 我是python3.6.5,这个有关系吗 |
本帖最后由 静哥哥 于 2022-6-11 11:16 编辑 卡开发发 发表于 2022-6-11 10:47 开发老师,请问下,我按照您的提示输入后会出现以下问题,请问这怎么解决呢 |
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静哥哥 发表于 2022-6-11 10:24 你试试看makeneb.py -i ISPOSCAR FSPOSCAR -n 5 --method idpp -i后面的文件名要按照你实际的反应物和产物的POSCAR文件名设置。 最好是加上-o的参数,会产生XDATCAR轨迹记录路径。之后用ase gui XDATCAR查看产生的结果,如果原子没有匹配再用其他程序进行调整。 |
卡开发发 发表于 2022-6-10 20:54 卡发老师,我发现的确有问题,我的模型是wo3做了222扩胞,然后去掉一个O得到初始结构并进行了优化。让后将空位处的W原子手动移到临近八面体位置,并进行了结构优化,得到了末态POSCAR. 用dist,pl计算距离大概3.7,因此我插入了4个点,用nebavoid.pl 使最小距离大于0.8,然后进行cineb计算。cineb我一般都是分成低中高三步,逐步优化,但是我发现跑了一晚上才跑了32步。我是8375的配置,64核,平时一样的结构跑CINEB,也就十几个小时左右就跑完了。今天这个的确有问题,麻烦您帮忙看看。多谢了。 |
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本帖最后由 静哥哥 于 2022-6-11 10:25 编辑 卡开发发 发表于 2022-6-10 20:54 卡发老师,请见下帖,我把poscar、incar等都上传了,麻烦您了 |
静哥哥 发表于 2022-6-10 19:04 可以把IS和FS传来看看。 |
卡开发发 发表于 2022-2-20 05:42 卡开发发老师,您好。我想找您请教两个问题 1、在算有阴离子空位时,钙钛矿结构里阳离子迁移到临近八面体间隙位,发现移动阳离子会导致周边阴离子位置变化较大,导致结构一直不收敛,前后结果检查了很多遍,没有问题,也尝试了用IOPT=1 3 7,都不收敛。而没有阴离子空位时阳离子迁移收敛很快。所以我考虑是不是插点有问题,因此想到使用idpp.py。但是研究了下发现不会用。 2、按照“使用ASE实现idpp方法插值NEB路径”一文中,比如我有初始和末态poscar,命令为IS 和FS。请问我需要产生插点,是这样用吗:python3 makeneb.py -i IS FS -n 5 --method idpp --optimizer BFGS 。每次这样调用,就会弹出使用帮助窗口,程序无法执行。所以向您请教下,麻烦了。 |
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