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费米软度的计算方法

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发布时间: 2022-2-17 16:39

正文摘要:

本帖最后由 linqiaosong 于 2022-2-17 23:02 编辑 费米软度的计算方法 (请先看第七~九节)原帖地址:Fermi-Softness-for-VASP:VASP计算费米软度的脚本 一、简介 费米软度是武汉大学黄冰、庄林等人在Angew上 ...

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linqiaosong 发表于 Post on 2023-12-12 10:18:13
huluobo123 发表于 2023-10-19 17:25
报错 **** !!!! Running vaspkit error! check the vaspkit.log !!!! ****,我检查了vaspkit路径没有问题, ...

看一下生成的vaspkit.log文件,很多时候是生成波函数格点太密集,然后vaspkit写波函数cube的时候内存溢出了
huluobo123 发表于 Post on 2023-10-19 17:25:02
报错 **** !!!! Running vaspkit error! check the vaspkit.log !!!! ****,我检查了vaspkit路径没有问题,有人知道报错原因吗?
chen0201 发表于 Post on 2022-11-19 16:37:32
linqiaosong 发表于 2022-11-18 17:27
这个具体可以查看bader的官网

好的,谢谢老师
linqiaosong 发表于 Post on 2022-11-18 17:27:52
chen0201 发表于 2022-11-18 15:33
谢谢老师,我有注意到您说的第七节,我目前只用了局域的费米软度,LFS.cube文件,另外您说的全电子的电荷 ...

这个具体可以查看bader的官网
chen0201 发表于 Post on 2022-11-18 15:33:34
linqiaosong 发表于 2022-11-16 21:36
1. 慢是很正常的,因为这东西我没写并行,是串行的,而且反复调用vaspkit读写格点,IO也会花很长时间。
...

谢谢老师,我有注意到您说的第七节,我目前只用了局域的费米软度,LFS.cube文件,另外您说的全电子的电荷密度的格点文件是算的CHGCAR吗?
linqiaosong 发表于 Post on 2022-11-16 21:36:05
本帖最后由 linqiaosong 于 2022-11-16 21:37 编辑
chen0201 发表于 2022-11-16 11:52
谢谢老师,我又重新测试了,确实生成了LFS.cube 和FSCAR,整个计算过程有三天左右,请问正常吗?计算过程 ...

1. 慢是很正常的,因为这东西我没写并行,是串行的,而且反复调用vaspkit读写格点,IO也会花很长时间。
2. 这个警告不是费米软度的警告,你可以检查一下你的vasp计算本身有没有不合理的地方。
3. 此外,关于vasp算出来的FSCAR,请留意我的第七节。

首先,FermiSoftness这个包里面我使用的是Bader划分方法做的原子划分,用于计算简缩费米软度,因为黄冰在博士论文中认为AIM划分方法会更好。勘误:目前的划分方法是错误的,FSCAR实际上得到的是按局域费米软度进行Bader划分,严格的做法应该是按全电子电荷密度进行Bader划分,因此正确的做法应该是去算一个全电子的电荷密度的格点文件(假设叫chgsum.cube),然后通过bader LFS.cube -ref chgsum.cube,这样得到的简缩费米软度数值才是正确的。

4. 关于vasp算出来的电荷密度格点与vaspkit的波函数格点不一致,造成无法通过bader计算简缩费米软度的情况,我无法解决,你可以咨询一下vaspkit的开发者。


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chen0201 发表于 Post on 2022-11-16 11:52:21
linqiaosong 发表于 2022-11-11 21:22
目测是没有正常结束,查看一下vaspkit.log文件是否有报错

谢谢老师,我又重新测试了,确实生成了LFS.cube 和FSCAR,整个计算过程有三天左右,请问正常吗?计算过程中有警告(如图),这个影响大吗?

202211161152393195..png (38.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 31)

202211161152393195..png
linqiaosong 发表于 Post on 2022-11-11 21:22:51
chen0201 发表于 2022-11-11 20:31
老师您好,我的费米软度已经开始运行,并且运行了一天多,最后只生成了.cube格式的文档 (和vaspkit生成的 ...

目测是没有正常结束,查看一下vaspkit.log文件是否有报错
chen0201 发表于 Post on 2022-11-11 20:31:10
老师您好,我的费米软度已经开始运行,并且运行了一天多,最后只生成了.cube格式的文档 (和vaspkit生成的好像差不多),没有LFS.cube和FSCAR文件,请问这是为什么呢?哪里出了问题呢?

202211112029349162..png (39.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 39)

202211112029349162..png
linqiaosong 发表于 Post on 2022-9-13 21:27:21
cliuimr 发表于 2022-8-30 11:50
请问一下,如果是半金属的话,那个VBM和CBM应该怎么设置呀?

费米软度对于半金属乃至非金属而言是否适用这个问题尚且是一个未知数,原文中应该只用来充当金属体系的描述符
cliuimr 发表于 Post on 2022-8-30 11:50:37
请问一下,如果是半金属的话,那个VBM和CBM应该怎么设置呀?
wypkdhd 发表于 Post on 2022-2-18 12:15:42
这是真超级的技术质量。
冰释之川 发表于 Post on 2022-2-18 11:22:14
松哥太强了……

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