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求助:Gaussian安装问题

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发布时间: 2022-2-23 11:17

正文摘要:

按照sob老师教程安装linux g16后,按照计算“计算RESP原子电荷的超级懒人脚本(一行命令就算出结果)”去计算RESP电荷,但gau.out提示 Entering Gaussian System, Link 0=g16 Files in the Gaussian directo ...

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qcn1211 发表于 Post on 2025-6-8 19:19:47
本帖最后由 qcn1211 于 2025-6-8 23:11 编辑

请问集群系统上out文件只有“Entering Gaussian System, Link 0=g16” 这一行字是出了什么问题?原来一直都正常
snljty2 发表于 Post on 2022-5-24 21:07:57
Roonry 发表于 2022-5-24 20:51
麻烦帮我看看有什么问题吗

不能叫g09D01,最底下一层目录必须叫g09。或者说你的Gaussian安装目录必须是$g09root/g09。
Roonry 发表于 Post on 2022-5-24 20:51:40
snljty2 发表于 2022-5-24 20:37
截图你的.bashrc。大概率是没设置g09root环境变量。

麻烦帮我看看有什么问题吗

无标题.png (47.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 82)

无标题.png
snljty2 发表于 Post on 2022-5-24 20:37:59
Roonry 发表于 2022-5-24 20:23
按照sob老师说的在虚拟机上安装gaussian09 但安装过程中出现问题 请问这个怎么解决

截图你的.bashrc。大概率是没设置g09root环境变量。
Roonry 发表于 Post on 2022-5-24 20:23:03
按照sob老师说的在虚拟机上安装gaussian09 但安装过程中出现问题 请问这个怎么解决

202205242021438331..png (17.5 KB, 下载次数 Times of downloads: 66)

202205242021438331..png
sun877469558 发表于 Post on 2022-2-26 13:11:59
casea 发表于 2022-2-25 23:16
5950X可以用avx2,社长gaussian安装教程有说明,http://sobereva.com/439

根据社长文章所述 http://sobereva.com/439
运行Gaussian前通过这行命令定义环境变量:export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge。
成功解决问题,谢谢
sun877469558 发表于 Post on 2022-2-26 13:11:03
snljty 发表于 2022-2-25 23:37
export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge如果分区格式希望双系统都能读取,可以考虑exFAT

感谢指导,按照您说的命令,已经解决问题
snljty 发表于 Post on 2022-2-25 23:37:08
sun877469558 发表于 2022-2-25 22:57
谢谢社长回复,原因找到了,因为我是双系统,安装g16的磁盘是ntfs,然后执行chmod时,即使是root也改不动 ...

export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge如果分区格式希望双系统都能读取,可以考虑exFAT
casea 发表于 Post on 2022-2-25 23:16:02
sun877469558 发表于 2022-2-25 22:57
谢谢社长回复,原因找到了,因为我是双系统,安装g16的磁盘是ntfs,然后执行chmod时,即使是root也改不动 ...

5950X可以用avx2,社长gaussian安装教程有说明,http://sobereva.com/439
sun877469558 发表于 Post on 2022-2-25 22:57:35
sobereva 发表于 2022-2-23 18:14
你先用ls -l看看当前目录下的Gaussian的那些文件是否对应了750的权限,如果chmod设置没生效,可能你根本就 ...

谢谢社长回复,原因找到了,因为我是双系统,安装g16的磁盘是ntfs,然后执行chmod时,即使是root也改不动,后来磁盘分区为ext4就可以了,但是现在我还有一个问题就是。我的电脑CPU是AMD 5950X,我装了G16-A03-AVX2,之前不了解,用的时候出现Error: illegal instruction, illegal opcode,看您2015年一个帖子回复,很可能是CPU架构与版本不兼容,请问,我应该用g16的哪个版本呢,或者只能换机子?
sobereva 发表于 Post on 2022-2-23 18:14:27
你先用ls -l看看当前目录下的Gaussian的那些文件是否对应了750的权限,如果chmod设置没生效,可能你根本就没修改的权限,用root账户改
abin 发表于 Post on 2022-2-23 13:44:57
按照Gaussian官方安装说明处理即可.
搞750操作, 某些时候会遇到麻烦.

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