student0618 发表于 2026-3-4 19:26
二楼及推荐帖已经写得很好了

老生常谈的grompp提示Invalid order for directive atomtypes报错答疑专 ...

感谢老师，我又仔细研究了一下，因为我的体系里有两个配体，我把第二个配体的atomtype合并到了第一个配体的itp文件中就可以了。

学不会太难啦 发表于 2026-3-4 16:28
您好，请问你解决了吗，我也遇到了这个问题，谢谢

二楼及推荐帖已经写得很好了

老生常谈的grompp提示Invalid order for directive atomtypes报错答疑专帖
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 3&fromuid=64740
(出处: 计算化学公社)

其他问题没实际文件无法解答

暖身贴 发表于 2024-12-11 14:20
您好，请问您解决了嘛，我也是

您好，请问你解决了吗，我也遇到了这个问题，谢谢

Alpaca 发表于 2023-5-27 21:00
您好，请问你解决了嘛，我也是单个配体和蛋白质

您好，请问您解决了嘛，我也是

skypeside 发表于 2022-7-28 10:58
top文件是这样的，它也是显示我报错atomtypes出现顺序错误，尝试用前面方法解决，还是失败了，希望各位老师 ...

您好，请问你解决了嘛，我也是单个配体和蛋白质

top文件是这样的，它也是显示我报错atomtypes出现顺序错误，尝试用前面方法解决，还是失败了，希望各位老师指教一下

您好我想请教一下如果只是做单个配体和蛋白的话也会出现这种情况要如何处理呢？

Z.Zzzzzzz 发表于 2022-6-9 16:40
请问是如何解决的，能把最后解决了的方法和文件附上吗，谢谢

我是把所有的都合并了，之前还有问题是因为其它itp里有重复的

牧生 发表于 2022-6-9 17:41
http://bbs.keinsci.com/thread-19761-1-1.html

感谢

Z.Zzzzzzz 发表于 2022-6-9 16:40
请问是如何解决的，能把最后解决了的方法和文件附上吗，谢谢

http://bbs.keinsci.com/thread-19761-1-1.html

Z.Zzzzzzz 发表于 2022-6-9 16:40
请问是如何解决的，能把最后解决了的方法和文件附上吗，谢谢

认真看2L的slide。没法说的更详细了。

494085639 发表于 2022-2-24 22:21
谢谢老师我解决了麻烦您了

请问是如何解决的，能把最后解决了的方法和文件附上吗，谢谢

sobereva 发表于 2022-2-24 21:18
把[ atomtypes ]合并到ffonbonded.itp的[ atomtypes ]里，如果还有问题，说明其它itp里还有这种字段

...

谢谢老师我解决了麻烦您了

494085639 发表于 2022-2-24 19:56
老师麻烦您，我更改以后依然会出现这个错误
Fatal error:
Syntax error - File FES1.itp, line 3

把[ atomtypes ]合并到ffonbonded.itp的[ atomtypes ]里，如果还有问题，说明其它itp里还有这种字段

始终记住grompp看到的是所有include之后都展开后的内容，ppt里明确说了