sob老师,按照GROMACS2018.4在CentOS 7.6下的安装过程演示(https://www.bilibili.com/video/av39749252/)安装,其中cmake和fftw都正常安装上了,但是安装gromacs过程中出现如图错误提示,请问怎么处理 |
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Caca-line 发表于 2022-2-24 18:26 用vi编辑 |
snljty 发表于 2022-2-24 16:53 我看了报错的问题觉得可能是我系统中没有C++编译器导致的,因为我也是刚开始自学这个,您这边第二行cmake。。。这些内容是要在哪里调整的? 根据第一行代码安装了gcc-c++的编译器,需要在重新安装cmake和fftw吗? |
Caca-line 发表于 2022-2-24 16:35 sudo yum install gcc-c++ gcc-gfortran cmake改成CC=gcc FC=gfortarn CXX=g++ cmake。注意别再看错有没有空格了。 |
1 安装cmake 3.x GROMACS 2018需要系统里有cmake 3.x才能编译。CentOS 7.6自带的cmake版本太老,因此需要先装cmake 3.x。 首先运行以下命令,添加EPEL源 yum install epel-release 然后在终端里输入yum install cmake3即可下载和安装cmake包,遇到提示的时候都输入y。之后输入cmake3 /V命令,如果显示出了3.x的版本号就说明没问题了。 注1:如果用yum的时候出现乱七八糟的提示安装不了,把操作系统重启一下往往就好了。 这个操作绝对不会出任何问题 |
sobereva 发表于 2022-2-24 11:42 我想问下就是视频中在安装好cmake也没有出现cmake的文件之类的,我安装完了同样也是没有文件出现,所以我想问下这个cmake是安装到了那里? |
snljty 发表于 2022-2-24 14:15 非常感谢您的提醒,经过调整之后有产生了新的错误,无法找到安转的cmake,应该如何处理呢? 错误代码如下: -- The CXX compiler identification is unknown CMake Error at CMakeLists.txt:41 (project): No CMAKE_CXX_COMPILER could be found. Tell CMake where to find the compiler by setting either the environment variable "CXX" or the CMake cache entry CMAKE_CXX_COMPILER to the full path to the compiler, or to the compiler name if it is in the PATH. -- Configuring incomplete, errors occurred! See also "/home/hc/sob/gromacs-2018.8/build/CMakeFiles/CMakeOutput.log". See also "/home/hc/sob/gromacs-2018.8/build/CMakeFiles/CMakeError.log". |
Caca-line 发表于 2022-2-24 12:05 两个点后面有个空格,卢老师都说了让你认真检查一下空格...... |
sobereva 发表于 2022-2-24 11:42 除了前两行获取root权限的,代码总共就3行,这个文件路径都是写的sob,但是提示却是/home/hc/sob,所以是不是sob的位置有问题 |
看清楚博文里每一个空格 视力不好就直接复制 GROMACS的安装方法(含全程视频演示) http://sobereva.com/457(http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html) 搞清楚路径,别一会儿/sob一会儿/home/hc/sob |
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