含有小分子的聚合物在完成一次弛豫后在进行nvt报错

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发布时间: 2022-3-1 19:18

各位前辈，我对含有小分子的聚合物进行能量最小化，在进行弛豫后想在进行NVT后求均方位移曲线，但是这次NVT没有成功，报错如下图，想请教一下造成这种现象的原因是什么，怎么解决？

回复 Reply

风起于夏 发表于 Post on 2022-3-3 09:24:38

sobereva 发表于 2022-3-2 22:04
我不知道你具体怎么跑的
继续进行NVT的时候要通过之前的cpt文件延续最后的坐标和速度

好的老师

sobereva 发表于 Post on 2022-3-2 22:04:21

风起于夏发表于 2022-3-2 08:37
老师，我还是不太清楚，我已经进行了NVT和NPT(这是不是说明初始结构和拓扑文件是合理的)，再次进行NVT显 ...

我不知道你具体怎么跑的
继续进行NVT的时候要通过之前的cpt文件延续最后的坐标和速度

风起于夏 发表于 Post on 2022-3-2 08:37:01

sobereva 发表于 2022-3-2 03:07

老师，我还是不太清楚，我已经进行了NVT和NPT(这是不是说明初始结构和拓扑文件是合理的)，再次进行NVT显示了LINCS报错还可能是初始结构或者拓扑文件的原因吗

sobereva 发表于 Post on 2022-3-2 03:07:17

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